More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1077 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  54.06 
 
 		 734 aa  748    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 856 aa  1712    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  35.81 
 
 		 822 aa  380  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  34.17 
 
 		 777 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  34.55 
 
 		 784 aa  375  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  34.03 
 
 		 795 aa  317  8e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 		 777 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 752 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 747 aa  253  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 766 aa  244  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 847 aa  244  7e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 753 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 712 aa  234  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 742 aa  230  8e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 763 aa  230  8e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 802 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 792 aa  226  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 791 aa  225  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  28.01 
 
 		 785 aa  224  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 786 aa  220  8.999999999999998e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 757 aa  218  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  27.57 
 
 		 771 aa  217  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 807 aa  216  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 762 aa  214  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 795 aa  211  7e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  27 
 
 		 889 aa  210  9e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 788 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 806 aa  202  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 808 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 780 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 780 aa  191  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 		 804 aa  190  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 795 aa  188  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 808 aa  187  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 798 aa  187  9e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 737 aa  185  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 774 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 875 aa  184  6e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 904 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 781 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 802 aa  181  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4738  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 756 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  26.39 
 
 		 755 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 796 aa  177  8e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_1502  TonB-dependent receptor, plug  29.1 
 
 		 801 aa  177  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 724 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 797 aa  174  7.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1106  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 829 aa  172  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 723 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 720 aa  172  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 735 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 797 aa  171  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  25.73 
 
 		 767 aa  171  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 747 aa  171  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 728 aa  170  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 763 aa  169  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 729 aa  169  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 765 aa  169  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 790 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 761 aa  167  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 753 aa  167  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 733 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 766 aa  164  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 730 aa  164  7e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 704 aa  164  9e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 722 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0787  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 788 aa  161  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.114604  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0785  TonB-dependent receptor, plug  24.41 
 
 		 829 aa  161  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324932  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3044  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 775 aa  161  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000826445  unclonable  0.00000113602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 726 aa  161  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 755 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 741 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 741 aa  159  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 759 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 783 aa  159  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  25.7 
 
 		 739 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 769 aa  159  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 755 aa  158  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 763 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 790 aa  157  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1810  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 770 aa  157  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 851 aa  157  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 853 aa  156  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 736 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 743 aa  156  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 771 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 732 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 755 aa  156  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 783 aa  155  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 761 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 803 aa  155  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 767 aa  155  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 775 aa  155  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 790 aa  154  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2726  TonB-dependent receptor plug  26.25 
 
 		 829 aa  154  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.298925 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 754 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 771 aa  154  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0968  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 709 aa  154  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 746 aa  152  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 771 aa  152  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>