More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1679 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  54.37 
 
 		 758 aa  791    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  57.18 
 
 		 731 aa  830    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1059  TonB-dependent receptor  52.89 
 
 		 777 aa  781    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000502668  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1679  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 742 aa  1503    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0383405 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  46.09 
 
 		 757 aa  606  9.999999999999999e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  45.95 
 
 		 761 aa  605  1.0000000000000001e-171  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  45.69 
 
 		 763 aa  593  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  45.54 
 
 		 776 aa  583  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  42.58 
 
 		 769 aa  562  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  44.11 
 
 		 754 aa  543  1e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02728  TonB-dependent outer membrane receptor  44.17 
 
 		 738 aa  538  1e-151  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 747 aa  257  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 773 aa  236  9e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 771 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 794 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  30.7 
 
 		 773 aa  233  9e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 763 aa  218  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 771 aa  210  9e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 761 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 737 aa  204  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 704 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  26.52 
 
 		 755 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.46 
 
 		 759 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 761 aa  192  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 743 aa  192  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 782 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 734 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 725 aa  184  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 743 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 741 aa  181  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 780 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 731 aa  177  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 785 aa  174  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 790 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 748 aa  174  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 730 aa  174  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 773 aa  173  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 767 aa  173  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 784 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 761 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 779 aa  172  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 764 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 720 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 771 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 749 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 783 aa  169  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 726 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 723 aa  168  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 710 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 722 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00767  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 772 aa  165  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  25.88 
 
 		 759 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 758 aa  164  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 764 aa  163  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 746 aa  163  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 765 aa  163  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 797 aa  163  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  24.74 
 
 		 695 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 780 aa  162  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 803 aa  161  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  25.09 
 
 		 799 aa  161  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  26.36 
 
 		 715 aa  161  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 789 aa  160  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 764 aa  160  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 798 aa  160  8e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  30.03 
 
 		 739 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  25.37 
 
 		 754 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 735 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 810 aa  157  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 736 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 786 aa  157  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 796 aa  156  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 726 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 792 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 730 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 780 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 777 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 758 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 822 aa  154  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 758 aa  155  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 755 aa  155  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 702 aa  154  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 758 aa  154  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 758 aa  154  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 751 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 803 aa  154  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 789 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 800 aa  153  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 800 aa  153  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 687 aa  153  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 862 aa  153  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 730 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 804 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 728 aa  152  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 732 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  26.2 
 
 		 733 aa  151  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 785 aa  150  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 778 aa  150  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 775 aa  150  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 788 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>