More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1702 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 788 aa  1593    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  30.7 
 
 		 720 aa  292  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 764 aa  266  8e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 732 aa  265  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 722 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 777 aa  236  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 704 aa  233  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 786 aa  232  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 728 aa  233  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 749 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 741 aa  231  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 730 aa  230  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 751 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 722 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 790 aa  228  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 730 aa  228  4e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 724 aa  226  9e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 726 aa  226  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 734 aa  225  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 808 aa  225  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 710 aa  225  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 761 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 780 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 784 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  28.37 
 
 		 755 aa  223  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 790 aa  223  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 778 aa  223  9e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 741 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 780 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 730 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 729 aa  220  7e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 736 aa  220  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 800 aa  219  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 800 aa  219  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 763 aa  217  5.9999999999999996e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 803 aa  217  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0787  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 788 aa  216  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.114604  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 757 aa  214  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 765 aa  214  7e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 778 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 804 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 771 aa  212  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 743 aa  212  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  27.52 
 
 		 767 aa  211  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 780 aa  210  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 731 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2110  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 765 aa  208  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0914186  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.01 
 
 		 739 aa  208  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 797 aa  208  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 838 aa  207  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 771 aa  207  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 723 aa  206  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 785 aa  205  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 784 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  27.28 
 
 		 759 aa  204  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 864 aa  204  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 835 aa  204  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  28.99 
 
 		 759 aa  203  8e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 851 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 743 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 745 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 761 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 794 aa  202  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 783 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 790 aa  201  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 726 aa  201  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 779 aa  201  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 787 aa  201  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 853 aa  200  7.999999999999999e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 814 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 780 aa  198  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 873 aa  197  5.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 771 aa  197  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3637  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 858 aa  195  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 762 aa  195  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 753 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.49 
 
 		 695 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 825 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 737 aa  194  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 779 aa  193  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 771 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 755 aa  192  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 822 aa  191  5.999999999999999e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 794 aa  190  7e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 775 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2919  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 763 aa  190  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.239028  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 769 aa  189  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 851 aa  189  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 774 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 817 aa  188  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 758 aa  188  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 763 aa  187  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  26.21 
 
 		 715 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 717 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 796 aa  186  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 797 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 755 aa  185  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 783 aa  184  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 759 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 803 aa  184  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>