More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0921 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 889 aa  1801    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  45.71 
 
 		 791 aa  654    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  43.79 
 
 		 780 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  42.65 
 
 		 781 aa  567  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  42.61 
 
 		 780 aa  566  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  32.48 
 
 		 785 aa  344  4e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  32.59 
 
 		 757 aa  293  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 762 aa  279  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 807 aa  278  4e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 747 aa  271  5e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  28.81 
 
 		 771 aa  259  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 802 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 753 aa  250  8e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 786 aa  250  9e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 712 aa  237  6e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 795 aa  236  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  29.42 
 
 		 784 aa  235  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 763 aa  226  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 766 aa  220  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 792 aa  217  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 806 aa  215  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  29.06 
 
 		 822 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 752 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 742 aa  207  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  26.54 
 
 		 856 aa  204  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 777 aa  204  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 795 aa  196  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 904 aa  193  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 734 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 797 aa  188  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 802 aa  188  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 788 aa  187  9e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 798 aa  185  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 753 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 808 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 777 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  28.97 
 
 		 695 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 795 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 700 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 875 aa  174  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 790 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 847 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 792 aa  172  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 704 aa  171  7e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 724 aa  168  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 808 aa  167  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0968  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 709 aa  164  9e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 761 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 713 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 778 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 775 aa  155  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 758 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  23.73 
 
 		 804 aa  153  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 746 aa  152  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 710 aa  152  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 761 aa  152  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4008  TonB-dependent receptor plug  34.84 
 
 		 365 aa  151  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 766 aa  151  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1080  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 937 aa  150  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72185  normal  0.584922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 702 aa  149  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 733 aa  147  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 767 aa  147  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 751 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1050  TonB-dependent receptor, plug  24.22 
 
 		 830 aa  145  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.908027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 763 aa  144  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 765 aa  144  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 720 aa  144  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 807 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 790 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 778 aa  141  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 729 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0767  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 883 aa  140  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000108797  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 757 aa  140  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 853 aa  139  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  26.07 
 
 		 776 aa  138  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 786 aa  138  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 725 aa  137  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 771 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 741 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 790 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 794 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 774 aa  137  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 790 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 851 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 720 aa  135  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 732 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 735 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 764 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 803 aa  134  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  24.15 
 
 		 767 aa  134  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 690 aa  134  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 763 aa  134  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  23.75 
 
 		 846 aa  133  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 730 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  25.68 
 
 		 755 aa  132  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0808  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 733 aa  131  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 736 aa  131  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  25.35 
 
 		 759 aa  130  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 764 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 726 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>