More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0178 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0178  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 841 aa  1710    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1066  TonB-dependent receptor  45.86 
 
 		 844 aa  732    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308413  normal  0.134897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2033  TonB-dependent receptor  49.76 
 
 		 818 aa  801    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.795127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 732 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  32.03 
 
 		 767 aa  292  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 733 aa  260  7e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 702 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 718 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4145  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 737 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072691  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  36.59 
 
 		 700 aa  177  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 777 aa  164  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  24.94 
 
 		 759 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3508  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 840 aa  155  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 726 aa  155  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 771 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  34.23 
 
 		 695 aa  153  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 764 aa  148  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 731 aa  149  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 788 aa  149  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 822 aa  147  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 769 aa  140  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 765 aa  138  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 802 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 769 aa  135  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  31 
 
 		 717 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 732 aa  133  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 731 aa  132  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  34.94 
 
 		 720 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 754 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 713 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 771 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 862 aa  128  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  37.2 
 
 		 730 aa  127  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 756 aa  124  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 780 aa  124  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 780 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  34.33 
 
 		 715 aa  123  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1912  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 		 969 aa  123  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 791 aa  122  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 758 aa  121  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 713 aa  121  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  22.77 
 
 		 775 aa  121  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 919 aa  120  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  35.24 
 
 		 751 aa  120  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 786 aa  120  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  32.03 
 
 		 757 aa  120  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 755 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 703 aa  119  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0535  TonB-dependent receptor  22.95 
 
 		 853 aa  117  8.999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.445687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 779 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  35.44 
 
 		 783 aa  115  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  35.94 
 
 		 787 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 779 aa  113  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 738 aa  113  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 767 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 757 aa  113  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 792 aa  112  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  33.77 
 
 		 773 aa  112  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  33.82 
 
 		 797 aa  112  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  34.84 
 
 		 797 aa  111  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 896 aa  110  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 758 aa  109  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  22.52 
 
 		 806 aa  109  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  33.2 
 
 		 790 aa  108  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  31.87 
 
 		 784 aa  108  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  37.61 
 
 		 763 aa  108  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 757 aa  108  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 781 aa  108  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 755 aa  108  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 742 aa  108  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  33.33 
 
 		 739 aa  107  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0785  TonB-dependent receptor, plug  39.39 
 
 		 829 aa  107  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324932  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 778 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  22.93 
 
 		 771 aa  106  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 		 795 aa  106  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1474  TonB-dependent receptor  36.2 
 
 		 817 aa  105  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.698611  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4085  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 685 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.141893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 815 aa  105  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  32.6 
 
 		 790 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  33.62 
 
 		 774 aa  105  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  32.27 
 
 		 704 aa  105  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 773 aa  104  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  36.04 
 
 		 864 aa  104  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 		 903 aa  103  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 796 aa  103  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2998  helix-turn-helix, AraC type  32.04 
 
 		 797 aa  103  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000224907 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0450  TonB-dependent receptor, plug  31.01 
 
 		 487 aa  103  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144048  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1059  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 777 aa  103  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000502668  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  31.47 
 
 		 729 aa  103  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 804 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  35.65 
 
 		 710 aa  103  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 779 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  30.46 
 
 		 759 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 764 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 722 aa  102  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 730 aa  102  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  29.8 
 
 		 839 aa  102  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1679  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 742 aa  102  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0383405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  32.57 
 
 		 780 aa  102  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  25.32 
 
 		 906 aa  100  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>