More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1889 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1889  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 817 aa  1656    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2469  TonB-dependent receptor  34.88 
 
 		 843 aa  390  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3508  TonB-dependent receptor  34.11 
 
 		 840 aa  382  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3469  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 		 824 aa  372  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 769 aa  277  4e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 720 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 783 aa  227  7e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 732 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 776 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.68 
 
 		 739 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 780 aa  204  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  25.72 
 
 		 776 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  26.81 
 
 		 755 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 790 aa  191  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 726 aa  189  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 790 aa  187  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 761 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 784 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 838 aa  186  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 734 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 790 aa  185  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 803 aa  184  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 733 aa  184  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3044  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 775 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000826445  unclonable  0.00000113602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 747 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 710 aa  181  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 729 aa  178  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 783 aa  179  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 778 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 785 aa  179  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 780 aa  178  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  27.05 
 
 		 767 aa  177  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0667  putative TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 793 aa  176  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 803 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 771 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3395  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 713 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000531057  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 728 aa  176  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 741 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2319  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 765 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000203975  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 786 aa  174  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 757 aa  174  7.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 873 aa  173  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 860 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 787 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 728 aa  172  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 778 aa  171  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 758 aa  171  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 771 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  27.07 
 
 		 754 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2919  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 763 aa  170  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.239028  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 764 aa  169  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 780 aa  168  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 817 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 825 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 808 aa  166  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 723 aa  164  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 758 aa  164  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 779 aa  164  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 867 aa  162  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 777 aa  160  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 800 aa  159  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 800 aa  159  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3473  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 786 aa  159  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 761 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 730 aa  158  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  25.22 
 
 		 748 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 855 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 779 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 766 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 749 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 809 aa  155  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 765 aa  154  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 736 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 784 aa  154  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 808 aa  152  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  25.84 
 
 		 759 aa  151  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0787  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 788 aa  151  6e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.114604  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  26.17 
 
 		 695 aa  150  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 848 aa  150  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 755 aa  150  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 743 aa  150  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 794 aa  150  9e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 792 aa  150  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4555  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 803 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333953 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 797 aa  150  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 851 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 769 aa  148  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 796 aa  147  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 756 aa  147  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 790 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 758 aa  146  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 864 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 785 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 743 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 859 aa  144  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 730 aa  144  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 804 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 761 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 744 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  25.07 
 
 		 799 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>