More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1547 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  100 
 
 
794 aa  1622    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  43.66 
 
 
747 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  35.2 
 
 
773 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  35.5 
 
 
771 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  36.68 
 
 
773 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 
763 aa  299  1e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  31.38 
 
 
761 aa  278  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 
746 aa  278  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 
741 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  29.97 
 
 
755 aa  260  6e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 
743 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 
761 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 
775 aa  250  8e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 
728 aa  248  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 
764 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 
725 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 
778 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 
730 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 
765 aa  244  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 
762 aa  243  9e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 
704 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 
783 aa  241  4e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  30 
 
 
713 aa  240  8e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  29.28 
 
 
759 aa  239  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 
778 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 
771 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.59 
 
 
739 aa  238  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  29.24 
 
 
695 aa  236  9e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 
741 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 
764 aa  235  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  29.49 
 
 
767 aa  234  4.0000000000000004e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 
729 aa  234  5e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 
732 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1059  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 
777 aa  231  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000502668  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 
743 aa  231  6e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 
803 aa  230  8e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 
710 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 
790 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  31.21 
 
 
733 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  28.46 
 
 
790 aa  229  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 
758 aa  226  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02728  TonB-dependent outer membrane receptor  28.31 
 
 
738 aa  226  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 
790 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1679  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 
742 aa  226  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0383405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 
745 aa  225  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 
774 aa  226  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 
743 aa  224  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 
755 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 
853 aa  224  6e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 
786 aa  224  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 
731 aa  224  6e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  26.25 
 
 
755 aa  224  7e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  26.65 
 
 
748 aa  224  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 
759 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 
758 aa  221  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 
851 aa  221  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 
755 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 
758 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 
723 aa  221  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 
750 aa  220  6e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 
731 aa  220  8.999999999999998e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 
700 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 
730 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 
792 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 
758 aa  219  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  26.63 
 
 
754 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 
720 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 
757 aa  218  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 
726 aa  217  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 
769 aa  217  8e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 
733 aa  217  8e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 
808 aa  216  9e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 
873 aa  216  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 
736 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 
803 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 
758 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 
800 aa  213  9e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 
800 aa  213  9e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 
794 aa  213  9e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 
776 aa  213  9e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 
758 aa  213  9e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  27.36 
 
 
715 aa  212  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 
722 aa  213  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 
789 aa  212  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 
769 aa  211  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 
758 aa  211  6e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 
773 aa  210  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 
783 aa  209  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 
726 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 
756 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 
786 aa  208  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 
796 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 
782 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 
717 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 
817 aa  208  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 
730 aa  207  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 
763 aa  208  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 
761 aa  207  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 
737 aa  207  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 
808 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>