More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0931 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 747 aa  1514    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 		 763 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  34.16 
 
 		 802 aa  332  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  31.24 
 
 		 785 aa  318  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  31 
 
 		 786 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 806 aa  301  4e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  29.68 
 
 		 771 aa  296  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 795 aa  294  3e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 807 aa  292  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  31.08 
 
 		 822 aa  288  2.9999999999999996e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 		 753 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  30.96 
 
 		 889 aa  283  7.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  31.2 
 
 		 757 aa  282  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 734 aa  273  9e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 797 aa  265  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 780 aa  262  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 802 aa  263  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 791 aa  261  4e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 780 aa  260  7e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  30.48 
 
 		 762 aa  259  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  28.57 
 
 		 856 aa  257  6e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 781 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 712 aa  253  8.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  29.38 
 
 		 784 aa  250  7e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 752 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 742 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 777 aa  228  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 766 aa  224  6e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 808 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 808 aa  219  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 792 aa  219  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  26.86 
 
 		 804 aa  213  9e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 710 aa  211  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 730 aa  210  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 875 aa  203  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 777 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 743 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 795 aa  197  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 795 aa  197  8.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 798 aa  196  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 763 aa  191  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 753 aa  188  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 704 aa  185  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 790 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 788 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 724 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1050  TonB-dependent receptor, plug  25.65 
 
 		 830 aa  182  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.908027 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  24.35 
 
 		 846 aa  181  5.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 904 aa  180  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 775 aa  179  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 747 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 771 aa  178  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 822 aa  178  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2726  TonB-dependent receptor plug  26.48 
 
 		 829 aa  177  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.298925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 792 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 730 aa  176  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 767 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  26.87 
 
 		 695 aa  173  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 784 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 847 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4738  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 756 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 734 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 763 aa  170  9e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4145  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 737 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072691  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 723 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 787 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 786 aa  167  5e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 749 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 728 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 761 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0767  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 883 aa  165  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000108797  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 766 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 794 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 769 aa  163  9e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 718 aa  163  9e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 713 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 731 aa  162  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 773 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 717 aa  161  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 720 aa  161  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 736 aa  161  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 702 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 784 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 726 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 764 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 803 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 755 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 744 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 713 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 780 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 758 aa  157  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 783 aa  156  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 794 aa  155  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 733 aa  155  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 722 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 743 aa  154  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 803 aa  154  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 746 aa  153  8.999999999999999e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0968  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 709 aa  153  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 853 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>