More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5439 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  43.09 
 
 		 931 aa  728    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 962 aa  1965    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0089  TonB-dependent receptor  37.13 
 
 		 957 aa  591  1e-167  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0830  TonB-dependent receptor  32.85 
 
 		 933 aa  478  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.926876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  32.13 
 
 		 924 aa  416  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3601  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 1090 aa  352  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000169408  hitchhiker  0.00028286 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1988  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 		 1003 aa  320  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.485528  normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 957 aa  306  2.0000000000000002e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1716  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 1051 aa  296  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.854404  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3993  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 897 aa  233  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.494791  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3857  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 1077 aa  231  4e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03436  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 856 aa  204  5e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 920 aa  197  8.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0637  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 916 aa  196  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0978738  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 922 aa  195  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3580  TonB-dependent receptor, plug  23.57 
 
 		 894 aa  181  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0553281  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  26.06 
 
 		 932 aa  133  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  22.36 
 
 		 962 aa  132  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  21.81 
 
 		 946 aa  131  5.0000000000000004e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  33.2 
 
 		 927 aa  129  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  32.76 
 
 		 991 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 917 aa  125  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  34.02 
 
 		 1001 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2523  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 943 aa  122  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2575  TonB-dependent receptor  31.36 
 
 		 897 aa  122  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.118608 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1893  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 941 aa  118  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.175561 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0379  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 888 aa  118  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0418446  normal  0.660962 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 1004 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 938 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1056  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 888 aa  106  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0268559  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2082  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 942 aa  105  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  33.04 
 
 		 919 aa  105  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 972 aa  105  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0313  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 897 aa  104  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  22.96 
 
 		 917 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  29 
 
 		 848 aa  102  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 901 aa  97.8  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  29.58 
 
 		 833 aa  94  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2438  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 892 aa  92.4  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.615124  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1493  outer membrane protein  27.84 
 
 		 929 aa  92  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.684854  normal  0.108065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 936 aa  92  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 961 aa  87.4  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  39.64 
 
 		 1089 aa  87  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 		 924 aa  85.5  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2207  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 944 aa  84.7  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3988  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 945 aa  84  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  27.14 
 
 		 972 aa  83.6  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 943 aa  78.6  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  27.63 
 
 		 1147 aa  78.6  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 		 1079 aa  78.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 933 aa  78.2  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 935 aa  77.8  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 798 aa  77.4  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 753 aa  75.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 836 aa  75.9  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 793 aa  75.5  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  30.55 
 
 		 772 aa  75.1  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 		 817 aa  74.3  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  37.88 
 
 		 779 aa  74.3  0.000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 772 aa  73.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  29.96 
 
 		 1062 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 828 aa  73.2  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 897 aa  73.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  27.62 
 
 		 753 aa  72.4  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  36.28 
 
 		 952 aa  72.4  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1074 aa  72.4  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 1036 aa  72  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  33.54 
 
 		 806 aa  71.6  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 		 1077 aa  71.6  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  30.7 
 
 		 776 aa  71.2  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 973 aa  71.2  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 813 aa  70.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2369  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 935 aa  70.9  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  31.85 
 
 		 791 aa  70.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  36.08 
 
 		 1087 aa  69.7  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  32.94 
 
 		 792 aa  70.1  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  30.7 
 
 		 814 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  26.67 
 
 		 872 aa  70.1  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  26.37 
 
 		 791 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 853 aa  70.5  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  36.13 
 
 		 771 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  29.66 
 
 		 747 aa  69.3  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  32.67 
 
 		 1075 aa  68.6  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  31.78 
 
 		 822 aa  68.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  30.96 
 
 		 1004 aa  68.6  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1107 aa  68.2  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  26.69 
 
 		 775 aa  68.2  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  30.43 
 
 		 767 aa  68.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  33.12 
 
 		 1038 aa  67.8  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  30.2 
 
 		 942 aa  67.4  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  30.67 
 
 		 795 aa  67.4  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 		 769 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 958 aa  67.8  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 829 aa  66.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2153  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 		 1042 aa  67  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000607651  normal  0.711508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  27.44 
 
 		 1059 aa  66.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  26.14 
 
 		 1021 aa  66.6  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 845 aa  66.2  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 816 aa  65.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  37.1 
 
 		 1105 aa  66.2  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>