More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0613 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 808 aa  1653    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  38.26 
 
 		 788 aa  509  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  36.01 
 
 		 798 aa  481  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1050  TonB-dependent receptor, plug  34.43 
 
 		 830 aa  405  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.908027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 802 aa  272  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 753 aa  256  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 		 771 aa  253  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 734 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 757 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 791 aa  223  8e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 747 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  27.63 
 
 		 822 aa  207  7e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 762 aa  206  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 795 aa  204  6e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 777 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 712 aa  191  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 795 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  26.43 
 
 		 785 aa  187  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 763 aa  187  8e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  27.35 
 
 		 784 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  26.88 
 
 		 856 aa  184  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 752 aa  184  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 780 aa  183  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 777 aa  181  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 807 aa  181  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 742 aa  180  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 780 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 792 aa  177  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 808 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 710 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 786 aa  172  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 747 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 781 aa  171  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 875 aa  171  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 766 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 904 aa  168  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 847 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 724 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 720 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  25.55 
 
 		 889 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 806 aa  160  8e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 733 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  24.4 
 
 		 846 aa  158  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 795 aa  157  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 802 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 722 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 763 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 757 aa  151  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 797 aa  151  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 763 aa  149  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 790 aa  149  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 753 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 814 aa  146  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 790 aa  146  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 764 aa  145  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 766 aa  144  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 736 aa  144  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0787  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 788 aa  143  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.114604  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 790 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 723 aa  143  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 732 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 808 aa  141  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 803 aa  141  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 717 aa  141  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 726 aa  140  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 825 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 784 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  24.54 
 
 		 767 aa  137  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 734 aa  138  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 761 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 690 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 730 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 792 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  23.1 
 
 		 804 aa  135  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  24.13 
 
 		 695 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 778 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 744 aa  134  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 690 aa  134  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 785 aa  133  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 780 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 773 aa  132  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 767 aa  132  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 851 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 731 aa  131  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 786 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2726  TonB-dependent receptor plug  24.87 
 
 		 829 aa  130  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.298925 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 755 aa  130  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 729 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  24.19 
 
 		 759 aa  127  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2469  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 843 aa  127  9e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.36 
 
 		 685 aa  126  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 774 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 853 aa  126  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 743 aa  125  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3469  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 824 aa  125  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 778 aa  125  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 755 aa  125  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 782 aa  124  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 784 aa  124  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 775 aa  123  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>