116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1786 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1786  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 519 aa  1046    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.323375  hitchhiker  0.00000234079 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  42.34 
 
 		 509 aa  404  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  37.53 
 
 		 663 aa  279  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  26.25 
 
 		 494 aa  131  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  25.15 
 
 		 620 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  31.27 
 
 		 471 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  24.87 
 
 		 522 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  24.17 
 
 		 526 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  26.85 
 
 		 385 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  28.69 
 
 		 508 aa  110  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  28.01 
 
 		 480 aa  104  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  28.01 
 
 		 480 aa  102  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  24.6 
 
 		 479 aa  98.6  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  24.35 
 
 		 481 aa  98.2  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  22.06 
 
 		 485 aa  97.1  8e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  25.84 
 
 		 412 aa  95.9  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  26.44 
 
 		 502 aa  95.9  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  26.82 
 
 		 448 aa  95.5  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  27.29 
 
 		 469 aa  95.1  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  25.33 
 
 		 477 aa  93.6  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  26.26 
 
 		 455 aa  90.9  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  24.74 
 
 		 467 aa  90.1  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  26.03 
 
 		 402 aa  87.8  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  25.38 
 
 		 394 aa  86.7  9e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  28.9 
 
 		 389 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  26.03 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  27 
 
 		 634 aa  84  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  25.54 
 
 		 468 aa  84  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  26.55 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  27.11 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  32.48 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  24.23 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  27.94 
 
 		 433 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  25.93 
 
 		 394 aa  83.2  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  24.95 
 
 		 478 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  25.16 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  25.62 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  25.45 
 
 		 479 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  24.55 
 
 		 459 aa  80.9  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  23.03 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  23.59 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  28.16 
 
 		 500 aa  77.8  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  26.7 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  24.48 
 
 		 382 aa  76.3  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  31.05 
 
 		 462 aa  75.9  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  22.6 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  22.86 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 448 aa  73.6  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  23.12 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  23.12 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  24.43 
 
 		 456 aa  69.3  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  24.59 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  22.66 
 
 		 499 aa  67  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  27.72 
 
 		 453 aa  66.6  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2425  putative transcriptional regulator  25.97 
 
 		 472 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312863  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  24.56 
 
 		 383 aa  66.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  22.06 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  26.54 
 
 		 462 aa  65.9  0.000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  24.83 
 
 		 687 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  23.33 
 
 		 606 aa  65.1  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  21.76 
 
 		 484 aa  64.7  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  25.56 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  25.72 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  22.34 
 
 		 470 aa  63.5  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  24.71 
 
 		 628 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  25.85 
 
 		 462 aa  62.4  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  24.7 
 
 		 485 aa  62  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  28.33 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  24.58 
 
 		 611 aa  60.5  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  23.5 
 
 		 641 aa  60.5  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  30.37 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_002950  PG1512  hypothetical protein  26.84 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398828 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1151  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 163 aa  57  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.796033  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  23.33 
 
 		 456 aa  57  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  23.68 
 
 		 619 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  25.08 
 
 		 448 aa  55.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  31.28 
 
 		 475 aa  55.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  22.73 
 
 		 334 aa  55.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  27.02 
 
 		 492 aa  55.8  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  22.97 
 
 		 454 aa  54.7  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  22.96 
 
 		 456 aa  54.7  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  29.75 
 
 		 446 aa  53.9  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  21.11 
 
 		 582 aa  53.5  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3605  transcriptional regulator, TrmB  21.2 
 
 		 478 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0631  ATPase central domain-containing protein  29.19 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  28.88 
 
 		 311 aa  52.4  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  27.66 
 
 		 430 aa  52  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  23.24 
 
 		 472 aa  52  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0617  ATPase central domain-containing protein  30.26 
 
 		 377 aa  52  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1108  hypothetical protein  33.72 
 
 		 122 aa  51.6  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.617491  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0416  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.24 
 
 		 336 aa  52  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2716  putative transcriptional regulator  25.83 
 
 		 1123 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000820476  normal  0.236594 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3430  putative transcriptional regulator  24.81 
 
 		 483 aa  50.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  28.7 
 
 		 555 aa  49.7  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  29.08 
 
 		 358 aa  50.1  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  23.48 
 
 		 463 aa  49.7  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  21.66 
 
 		 545 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  23.74 
 
 		 581 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0638  putative transcriptional regulator  23.37 
 
 		 488 aa  49.3  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>