144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7144 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 582 aa  1169    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  42.4 
 
 		 572 aa  371  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  37.86 
 
 		 571 aa  343  7e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  36.41 
 
 		 492 aa  249  7e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3296  putative transcriptional regulator  36.86 
 
 		 478 aa  229  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0979413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3605  transcriptional regulator, TrmB  38.05 
 
 		 478 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2888  putative transcriptional regulator  36.69 
 
 		 602 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  30.35 
 
 		 634 aa  177  6e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  28.83 
 
 		 606 aa  171  4e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  26.36 
 
 		 687 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  29.45 
 
 		 456 aa  152  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  28.29 
 
 		 611 aa  151  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  27.92 
 
 		 619 aa  146  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  31.11 
 
 		 468 aa  134  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  28.6 
 
 		 641 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  24.46 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  23.85 
 
 		 455 aa  125  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  30.11 
 
 		 479 aa  123  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  28.64 
 
 		 459 aa  120  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  26.08 
 
 		 628 aa  117  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  25.49 
 
 		 622 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  23.72 
 
 		 561 aa  114  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  25.31 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  25 
 
 		 475 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  26.18 
 
 		 455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  28.95 
 
 		 422 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  27.37 
 
 		 448 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  25.15 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  25.31 
 
 		 545 aa  108  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  29.83 
 
 		 423 aa  107  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  26.11 
 
 		 456 aa  103  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  28.5 
 
 		 515 aa  101  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  28.64 
 
 		 456 aa  100  8e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  25.67 
 
 		 485 aa  100  9e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4173  putative transcriptional regulator  26.42 
 
 		 663 aa  99.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219897  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  28.08 
 
 		 423 aa  98.6  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0490  putative transcriptional regulator  26.98 
 
 		 504 aa  98.6  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362004 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  28.22 
 
 		 396 aa  98.2  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  26.29 
 
 		 620 aa  97.4  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  25.27 
 
 		 463 aa  97.4  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  27.06 
 
 		 423 aa  95.1  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  26.51 
 
 		 430 aa  94.7  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  25.11 
 
 		 620 aa  94  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  25.11 
 
 		 620 aa  94  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  27.81 
 
 		 663 aa  93.6  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  24.12 
 
 		 462 aa  90.9  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0048  putative transcriptional regulator  25.49 
 
 		 656 aa  90.9  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0052  putative transcriptional regulator  25.49 
 
 		 656 aa  90.5  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  24.61 
 
 		 462 aa  90.5  7e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1077  transcriptional regulator  23.56 
 
 		 448 aa  89.7  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000000030584  normal  0.489664 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  26.09 
 
 		 403 aa  89.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  26.09 
 
 		 403 aa  89.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  26.39 
 
 		 484 aa  89  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  26.27 
 
 		 481 aa  87.8  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  25.65 
 
 		 477 aa  87.8  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  25.46 
 
 		 386 aa  87.8  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5660  putative transcriptional regulator  27.4 
 
 		 643 aa  87.8  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  25.32 
 
 		 402 aa  87.4  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  25.42 
 
 		 448 aa  87.4  7e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3965  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.101474  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  24.84 
 
 		 494 aa  85.9  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0904  divergent AAA domain protein  25.54 
 
 		 543 aa  85.5  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  25.74 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  24.56 
 
 		 412 aa  83.2  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  24.73 
 
 		 480 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  22.03 
 
 		 457 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  24.46 
 
 		 480 aa  81.3  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  26.43 
 
 		 382 aa  80.1  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  24.37 
 
 		 479 aa  79  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  25.57 
 
 		 500 aa  78.6  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  24.67 
 
 		 509 aa  76.3  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  26.83 
 
 		 582 aa  75.9  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  25.5 
 
 		 469 aa  74.7  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  27.93 
 
 		 276 aa  74.3  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  23.5 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  25.59 
 
 		 467 aa  73.9  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  24.07 
 
 		 299 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0747  putative transcriptional regulator  22.04 
 
 		 483 aa  73.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.393903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  27.85 
 
 		 226 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  23.11 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  27.44 
 
 		 483 aa  72.4  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  26.61 
 
 		 376 aa  72  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  39.83 
 
 		 502 aa  70.9  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  28.7 
 
 		 472 aa  70.9  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  25.45 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  23.7 
 
 		 473 aa  70.5  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_002950  PG1512  hypothetical protein  28.5 
 
 		 205 aa  70.1  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398828 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  27.42 
 
 		 551 aa  69.7  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  29.53 
 
 		 402 aa  69.7  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  21.43 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  28.15 
 
 		 545 aa  68.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2425  putative transcriptional regulator  24.73 
 
 		 472 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312863  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  23.26 
 
 		 470 aa  68.2  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  24.2 
 
 		 454 aa  67.8  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  24.57 
 
 		 556 aa  67.4  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  30 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  24.03 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3430  putative transcriptional regulator  22.77 
 
 		 483 aa  63.5  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  31.1 
 
 		 581 aa  62.4  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>