More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2554 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2554  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 861 aa  1771    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1846  TonB-dependent receptor  49.71 
 
 		 851 aa  800    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 790 aa  197  9e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 786 aa  195  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 790 aa  191  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 835 aa  189  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0549  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 832 aa  187  9e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 803 aa  185  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 778 aa  183  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  24.84 
 
 		 767 aa  179  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 808 aa  178  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 800 aa  172  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 800 aa  172  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 778 aa  170  8e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3141  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 815 aa  161  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 771 aa  157  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 855 aa  149  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2555  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 833 aa  148  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 848 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 851 aa  145  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 814 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 794 aa  138  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 854 aa  136  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 747 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 873 aa  129  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0198  outer membrane receptor for iron transport  24.44 
 
 		 878 aa  127  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2637  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 773 aa  125  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 761 aa  125  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  23.94 
 
 		 755 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 741 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 761 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 864 aa  120  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  23.07 
 
 		 732 aa  115  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 775 aa  114  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 838 aa  113  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  24.3 
 
 		 759 aa  112  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4329  TonB-dependent receptor  21.73 
 
 		 734 aa  110  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.692193  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0144  TonB-dependent receptor  21.6 
 
 		 756 aa  109  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398028  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 853 aa  107  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 		 720 aa  107  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 896 aa  106  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 		 851 aa  105  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 862 aa  105  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  24.61 
 
 		 747 aa  104  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 713 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  22.06 
 
 		 723 aa  102  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 771 aa  101  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 758 aa  101  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 773 aa  100  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 771 aa  100  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 777 aa  100  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 773 aa  99.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  22.26 
 
 		 790 aa  99  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 741 aa  98.6  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 736 aa  97.8  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 755 aa  97.4  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  33.49 
 
 		 906 aa  97.4  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  22.41 
 
 		 722 aa  96.3  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  23.9 
 
 		 784 aa  95.9  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  22.78 
 
 		 757 aa  95.9  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  21.04 
 
 		 758 aa  95.5  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 755 aa  94.7  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 726 aa  93.2  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  22.94 
 
 		 731 aa  92  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 792 aa  91.7  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 903 aa  90.9  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 790 aa  90.1  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 783 aa  89.4  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  21.45 
 
 		 704 aa  89.7  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 713 aa  89.7  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 783 aa  89  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  21.52 
 
 		 713 aa  87  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 815 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  21.43 
 
 		 717 aa  87  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 726 aa  86.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 		 779 aa  87  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  22.94 
 
 		 730 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 808 aa  85.9  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  22.86 
 
 		 780 aa  85.9  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02728  TonB-dependent outer membrane receptor  25.78 
 
 		 738 aa  85.1  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  22.78 
 
 		 728 aa  85.1  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  22.09 
 
 		 712 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  21.76 
 
 		 715 aa  84.3  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  22.78 
 
 		 739 aa  84.3  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 777 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 779 aa  83.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  22.78 
 
 		 797 aa  83.2  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  22.44 
 
 		 765 aa  82.4  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3508  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 840 aa  82.8  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  21.82 
 
 		 822 aa  82  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  22.2 
 
 		 763 aa  82  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 880 aa  82  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3395  TonB-dependent receptor  22.9 
 
 		 713 aa  81.3  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000531057  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 802 aa  80.1  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  22.34 
 
 		 751 aa  80.5  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 733 aa  79.7  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  22.99 
 
 		 807 aa  79.7  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 919 aa  80.1  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  22.39 
 
 		 797 aa  79  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  22.16 
 
 		 780 aa  79  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>