More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0250 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  83.84 
 
 		 755 aa  1299    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 741 aa  1517    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  54.37 
 
 		 761 aa  773    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2919  TonB-dependent receptor  45.55 
 
 		 763 aa  618  1e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.239028  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  39.06 
 
 		 797 aa  476  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  36.51 
 
 		 798 aa  456  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  34.96 
 
 		 797 aa  399  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  34.5 
 
 		 783 aa  381  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  31.46 
 
 		 757 aa  306  7e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  32.85 
 
 		 786 aa  296  8e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 803 aa  287  5e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 747 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  32.1 
 
 		 778 aa  282  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  30.96 
 
 		 767 aa  278  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 		 778 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 794 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 769 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  32.04 
 
 		 755 aa  266  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 790 aa  264  6e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 		 790 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 800 aa  261  4e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 800 aa  261  4e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 771 aa  248  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 704 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 780 aa  244  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 854 aa  239  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 732 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 808 aa  238  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 835 aa  236  8e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  30.44 
 
 		 720 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 848 aa  233  7.000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 851 aa  233  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 873 aa  231  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0198  outer membrane receptor for iron transport  30.09 
 
 		 878 aa  231  3e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 785 aa  228  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 749 aa  227  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 765 aa  225  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 814 aa  225  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 790 aa  224  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 783 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 776 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 761 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 855 aa  221  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 788 aa  220  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 763 aa  218  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 728 aa  218  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 838 aa  218  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 776 aa  217  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 710 aa  218  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 817 aa  214  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 758 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 733 aa  214  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 792 aa  213  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 730 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  28.33 
 
 		 754 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 784 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 771 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0549  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 832 aa  212  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 728 aa  210  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02728  TonB-dependent outer membrane receptor  29.61 
 
 		 738 aa  210  9e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 729 aa  209  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  27.47 
 
 		 739 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 726 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 736 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 751 aa  207  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 779 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 722 aa  207  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 790 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 731 aa  205  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 726 aa  204  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 777 aa  204  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3469  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 824 aa  204  6e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 750 aa  204  7e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 762 aa  203  9e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 775 aa  203  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  25.35 
 
 		 776 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  26.24 
 
 		 715 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 730 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 903 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3508  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 840 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 783 aa  201  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 780 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 745 aa  201  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 731 aa  201  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 758 aa  200  7e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 758 aa  200  9e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 780 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 864 aa  200  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 758 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 758 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 763 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 717 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 776 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 769 aa  198  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 780 aa  198  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 764 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 782 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 787 aa  197  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 796 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  26.8 
 
 		 759 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>