More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2671 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2671  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1202 aa  2452    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000367152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0058  TonB-dependent receptor  39.89 
 
 		 1185 aa  776    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2947  TonB-dependent receptor plug  31.46 
 
 		 1161 aa  475  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.594997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5342  TonB-dependent receptor plug  29.95 
 
 		 1203 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135995  normal  0.0211304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6155  TonB-dependent receptor plug  28.59 
 
 		 1229 aa  442  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.597613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1354  TonB-dependent receptor plug  28.69 
 
 		 1230 aa  419  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  28.56 
 
 		 1181 aa  415  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3945  TonB-dependent receptor  29.83 
 
 		 1189 aa  408  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4497  TonB-dependent receptor plug  29.1 
 
 		 1198 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452901  normal  0.421044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0950  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 		 1199 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00543932  normal  0.368502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1991  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 1187 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694005  hitchhiker  0.000163482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  27.38 
 
 		 1211 aa  375  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1074  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 1190 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240766  normal  0.107047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6148  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 1218 aa  363  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2264  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 		 1175 aa  359  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.403047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2008  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 1198 aa  355  4e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3996  TonB-dependent receptor plug  27.16 
 
 		 1204 aa  352  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1036  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 1096 aa  352  3e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 1205 aa  344  5e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3048  TonB-dependent receptor plug  27.67 
 
 		 1220 aa  330  7e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  27.15 
 
 		 1150 aa  304  6.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  24.67 
 
 		 1219 aa  297  8e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  24.8 
 
 		 1219 aa  292  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2080  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 1158 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.301107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1734  TonB-dependent receptor plug  26.43 
 
 		 1136 aa  288  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2352  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 1085 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.456496 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0666  TonB-dependent receptor plug  25.41 
 
 		 1101 aa  273  1e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0721144  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  26.23 
 
 		 1152 aa  272  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  25.44 
 
 		 1237 aa  270  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 		 1114 aa  270  1e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  25.69 
 
 		 1155 aa  265  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  25.81 
 
 		 1111 aa  239  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  25.51 
 
 		 1106 aa  237  9e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  25.18 
 
 		 1135 aa  237  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  24.44 
 
 		 1122 aa  228  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4781  TonB-dependent receptor plug  24.32 
 
 		 1119 aa  221  6e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000704544  hitchhiker  0.00536077 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 		 1023 aa  217  9e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 1094 aa  216  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  24.98 
 
 		 1113 aa  216  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 1050 aa  215  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  24.96 
 
 		 1053 aa  211  7e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  24.06 
 
 		 1105 aa  210  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  25.5 
 
 		 1050 aa  208  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  25.95 
 
 		 1076 aa  203  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  24.57 
 
 		 1006 aa  202  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2273  TonB-dependent receptor plug  24.58 
 
 		 994 aa  202  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  25.7 
 
 		 1023 aa  201  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5203  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 1004 aa  192  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00178942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  24.7 
 
 		 986 aa  190  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 996 aa  189  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  25.21 
 
 		 1103 aa  189  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  27.08 
 
 		 1071 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  25.58 
 
 		 1164 aa  184  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 		 1154 aa  180  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  22.72 
 
 		 1080 aa  179  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1601  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 1055 aa  179  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.709185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 1189 aa  178  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  32.99 
 
 		 1089 aa  177  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4992  TonB-dependent receptor plug  23.16 
 
 		 1033 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00275317  normal  0.224873 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 		 1143 aa  174  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  23.46 
 
 		 1079 aa  173  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 1166 aa  171  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  24.69 
 
 		 1036 aa  168  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  28.96 
 
 		 925 aa  166  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4184  TonB-dependent receptor plug  26.8 
 
 		 1042 aa  166  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5705  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 1011 aa  166  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.091818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  30.02 
 
 		 1024 aa  165  5.0000000000000005e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 1065 aa  165  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  29.95 
 
 		 1127 aa  165  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 		 1146 aa  165  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2221  TonB-dependent receptor plug  23.07 
 
 		 1079 aa  164  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  27.75 
 
 		 979 aa  164  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1161 aa  163  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 		 1124 aa  162  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  30.3 
 
 		 1019 aa  162  5e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 1028 aa  162  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  28.66 
 
 		 1006 aa  161  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 		 1132 aa  159  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  24.03 
 
 		 1052 aa  159  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4660  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 894 aa  159  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120659  unclonable  0.0000000000000956087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5113  TonB-dependent receptor plug  30.52 
 
 		 1102 aa  158  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298267  normal  0.131345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  28.9 
 
 		 1181 aa  158  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  28.5 
 
 		 1169 aa  157  8e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 1109 aa  157  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  31.07 
 
 		 989 aa  157  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  29.9 
 
 		 1138 aa  156  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  31.9 
 
 		 1027 aa  156  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 1034 aa  156  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  30.02 
 
 		 1010 aa  156  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 1039 aa  155  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  31.1 
 
 		 1086 aa  155  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  23.64 
 
 		 1004 aa  155  5e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 		 1077 aa  154  8e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5062  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 		 1037 aa  154  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  30.32 
 
 		 1113 aa  154  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  26.74 
 
 		 1062 aa  153  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 1071 aa  154  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1127 aa  154  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 1101 aa  153  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  28.66 
 
 		 1120 aa  153  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>