More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4302 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 742 aa  1496    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  33.77 
 
 		 802 aa  349  1e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  31.37 
 
 		 771 aa  327  5e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 753 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 763 aa  294  5e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 734 aa  269  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  30.26 
 
 		 822 aa  261  3e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  30.52 
 
 		 784 aa  258  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 875 aa  253  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 808 aa  252  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 792 aa  249  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 786 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  29.19 
 
 		 785 aa  244  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 757 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 795 aa  236  9e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 766 aa  234  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 747 aa  233  8.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 795 aa  233  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  27.97 
 
 		 856 aa  231  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 752 aa  230  9e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 807 aa  229  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 847 aa  223  9e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 797 aa  219  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 802 aa  219  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 806 aa  216  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 712 aa  213  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  26.97 
 
 		 889 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  27.32 
 
 		 846 aa  209  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 777 aa  206  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 798 aa  201  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 788 aa  196  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 791 aa  194  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0767  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 883 aa  194  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000108797  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 777 aa  193  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 780 aa  193  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 762 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 781 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0968  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 709 aa  183  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 808 aa  183  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 780 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 795 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 744 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 720 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1080  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 937 aa  167  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72185  normal  0.584922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 904 aa  164  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 783 aa  164  8.000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 713 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 749 aa  162  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 724 aa  160  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 766 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  25.28 
 
 		 715 aa  158  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 730 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 736 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 783 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 747 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1050  TonB-dependent receptor, plug  25.46 
 
 		 830 aa  154  5.9999999999999996e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.908027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 775 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 777 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 763 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 713 aa  151  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2726  TonB-dependent receptor plug  24.4 
 
 		 829 aa  150  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.298925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 761 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 804 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 753 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  24.83 
 
 		 739 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4008  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 365 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 718 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  25.95 
 
 		 776 aa  144  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 755 aa  144  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 808 aa  143  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 797 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 790 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 751 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 775 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 790 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 723 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 700 aa  141  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 778 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 778 aa  140  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 738 aa  140  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 722 aa  140  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 790 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 732 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3395  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 713 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000531057  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  23.77 
 
 		 767 aa  139  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 782 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 803 aa  138  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 771 aa  137  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 722 aa  137  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4145  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 737 aa  137  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072691  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 743 aa  136  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 732 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 755 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 731 aa  136  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  25.06 
 
 		 729 aa  135  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 797 aa  135  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 755 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0787  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 788 aa  135  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.114604  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 794 aa  134  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 786 aa  133  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>