132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2367 on replicon NC_011061
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 509 aa  1039    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1786  putative transcriptional regulator  42.34 
 
 		 519 aa  404  1e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.323375  hitchhiker  0.00000234079 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  41.19 
 
 		 663 aa  314  2.9999999999999996e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  26.21 
 
 		 485 aa  121  3.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  27.7 
 
 		 481 aa  118  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  26.05 
 
 		 471 aa  117  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  26.52 
 
 		 455 aa  117  6e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  26.15 
 
 		 494 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  26.88 
 
 		 477 aa  115  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  26.31 
 
 		 479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  26.05 
 
 		 480 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  25.45 
 
 		 480 aa  101  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  28.12 
 
 		 402 aa  95.9  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  26.98 
 
 		 386 aa  93.6  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  24.93 
 
 		 508 aa  93.6  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  24.81 
 
 		 620 aa  91.7  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  27.65 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  23.93 
 
 		 385 aa  89.7  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  25.07 
 
 		 502 aa  89.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  27.91 
 
 		 469 aa  89  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  24.49 
 
 		 582 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3153  putative transcriptional regulator  26.5 
 
 		 611 aa  87  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880898  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  27.7 
 
 		 394 aa  86.7  8e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3608  putative transcriptional regulator  25.58 
 
 		 628 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.78709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  29.4 
 
 		 394 aa  86.3  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  24.8 
 
 		 433 aa  86.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  25.3 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  25.99 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  30.41 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  27.16 
 
 		 468 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  24.17 
 
 		 467 aa  82.8  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  22.83 
 
 		 634 aa  82.4  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  20.59 
 
 		 485 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1512  hypothetical protein  29.61 
 
 		 205 aa  81.6  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398828 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  24.26 
 
 		 455 aa  80.9  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  25.46 
 
 		 522 aa  80.5  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  26.51 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  24.71 
 
 		 561 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  25.84 
 
 		 456 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  28.21 
 
 		 479 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  24.8 
 
 		 403 aa  79.7  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  24.65 
 
 		 492 aa  79.7  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  24.8 
 
 		 403 aa  79.7  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  27.63 
 
 		 500 aa  79  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  25.19 
 
 		 526 aa  78.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  25.06 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  24.94 
 
 		 606 aa  77.4  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  23.59 
 
 		 687 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  25.3 
 
 		 299 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  26.49 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  26.79 
 
 		 538 aa  73.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  23.7 
 
 		 571 aa  73.6  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  23.75 
 
 		 478 aa  73.6  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  25.07 
 
 		 382 aa  73.2  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  21.58 
 
 		 484 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  30.28 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  25.12 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  24.57 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  23.32 
 
 		 412 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4927  ATP-dependent DNA helicase recG  31.78 
 
 		 198 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  27.25 
 
 		 448 aa  68.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  22.13 
 
 		 483 aa  67.8  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  24.62 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  23.04 
 
 		 572 aa  67.4  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  22.86 
 
 		 619 aa  67  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  30.05 
 
 		 276 aa  66.2  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  24.87 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  25.99 
 
 		 454 aa  65.5  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  25.28 
 
 		 456 aa  65.1  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  26.53 
 
 		 453 aa  64.7  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  24.95 
 
 		 456 aa  64.7  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  22.74 
 
 		 475 aa  64.3  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3605  transcriptional regulator, TrmB  23.91 
 
 		 478 aa  64.3  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  23.16 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  23.49 
 
 		 499 aa  63.9  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  22.68 
 
 		 463 aa  63.5  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  25.79 
 
 		 235 aa  62.4  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  24.75 
 
 		 462 aa  62.4  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  28.03 
 
 		 473 aa  62  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0734  hypothetical protein  25.34 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  27 
 
 		 545 aa  60.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  32.87 
 
 		 470 aa  60.5  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  24.94 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2716  putative transcriptional regulator  24.42 
 
 		 1123 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000820476  normal  0.236594 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  27.6 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0641  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  22.66 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  23.02 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  32.31 
 
 		 472 aa  57.8  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  23.06 
 
 		 641 aa  57  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  23.28 
 
 		 374 aa  57  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  25.36 
 
 		 446 aa  56.6  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0499  hypothetical protein  25.34 
 
 		 314 aa  56.6  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.12041 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  24.38 
 
 		 457 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1108  hypothetical protein  31.15 
 
 		 122 aa  55.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.617491  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1151  putative transcriptional regulator  27.45 
 
 		 163 aa  55.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.796033  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  34.44 
 
 		 620 aa  55.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  34.44 
 
 		 620 aa  55.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2888  putative transcriptional regulator  23.72 
 
 		 602 aa  55.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2425  putative transcriptional regulator  30.59 
 
 		 472 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>