More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2605 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  100 
 
 		 685 aa  1403    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1807  putative siderophore receptor protein  35.76 
 
 		 691 aa  342  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597664 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  33.18 
 
 		 680 aa  326  7e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3046  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 722 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.770987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0838  TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 671 aa  284  5.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2093  yersiniabactin/pesticin receptor FyuA  32.11 
 
 		 673 aa  280  4e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1436  TonB-dependent siderophore receptor  30.96 
 
 		 669 aa  254  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  30.67 
 
 		 715 aa  239  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1495  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 662 aa  224  4.9999999999999996e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0440927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 666 aa  194  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 720 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 687 aa  191  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 720 aa  190  7e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 732 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 724 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 713 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 695 aa  179  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 730 aa  176  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.42 
 
 		 695 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 690 aa  170  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 713 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 853 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 750 aa  164  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 700 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 851 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 746 aa  162  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4145  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 737 aa  162  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072691  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 751 aa  161  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  27.36 
 
 		 755 aa  160  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 764 aa  158  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 690 aa  159  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 786 aa  158  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 722 aa  157  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 702 aa  157  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 745 aa  157  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 713 aa  157  8e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 747 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 755 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 775 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 790 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 710 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 758 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 758 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 790 aa  154  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 704 aa  153  8e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 741 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 728 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 758 aa  153  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 773 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 726 aa  151  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 743 aa  151  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 771 aa  150  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 778 aa  150  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 774 aa  150  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 758 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 722 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 670 aa  148  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 773 aa  148  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 759 aa  147  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 758 aa  147  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 773 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 753 aa  146  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 717 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 726 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 749 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0808  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 733 aa  144  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 732 aa  144  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 780 aa  144  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 804 aa  144  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 778 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4085  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 685 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.141893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  27.42 
 
 		 767 aa  142  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 771 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 732 aa  140  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 763 aa  140  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 744 aa  140  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 761 aa  140  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 774 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 771 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 766 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 753 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 730 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 794 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 755 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 762 aa  137  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 729 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0007  TonB-dependent receptor  22.6 
 
 		 641 aa  137  9e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 803 aa  136  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  25.04 
 
 		 771 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  25.27 
 
 		 799 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 764 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55050  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 684 aa  134  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.04288e-20 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3473  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 786 aa  134  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 703 aa  134  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0144  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 756 aa  134  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398028  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 788 aa  134  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 763 aa  133  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 795 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0231  TonB-dependent siderophore receptor  26.46 
 
 		 771 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 780 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>