177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2604 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  100 
 
 		 387 aa  794    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  83.46 
 
 		 387 aa  668    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  78.81 
 
 		 387 aa  644    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  79.33 
 
 		 388 aa  642    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  82.43 
 
 		 387 aa  667    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  78.68 
 
 		 383 aa  631  1e-180  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  79.16 
 
 		 384 aa  631  1e-180  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  77.63 
 
 		 382 aa  611  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  75.71 
 
 		 387 aa  608  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  76.25 
 
 		 392 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  61.35 
 
 		 373 aa  472  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  46.76 
 
 		 372 aa  331  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  46.61 
 
 		 371 aa  318  7.999999999999999e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  44.3 
 
 		 382 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  41.87 
 
 		 380 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  43.99 
 
 		 372 aa  279  5e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  40.62 
 
 		 396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  39.57 
 
 		 392 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0501  alanine racemase domain protein  41.98 
 
 		 393 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  37.98 
 
 		 383 aa  243  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  39.12 
 
 		 400 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0490  alanine racemase domain-containing protein  41.98 
 
 		 393 aa  240  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502402  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  36.26 
 
 		 381 aa  238  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  38.42 
 
 		 381 aa  229  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  37.06 
 
 		 381 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  34.33 
 
 		 362 aa  207  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  33.79 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  32.26 
 
 		 376 aa  198  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  33.33 
 
 		 383 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  31.99 
 
 		 376 aa  193  4e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  32.52 
 
 		 349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  32.42 
 
 		 354 aa  180  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  32.43 
 
 		 349 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  32.55 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  32.64 
 
 		 366 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  33.24 
 
 		 359 aa  169  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  34.24 
 
 		 352 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  31.51 
 
 		 366 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  30.77 
 
 		 355 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  30.77 
 
 		 355 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  30.03 
 
 		 351 aa  145  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  32.08 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4878  alanine racemase domain protein  30.58 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.437822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  31.64 
 
 		 356 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  31.54 
 
 		 360 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  31.69 
 
 		 386 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  29.37 
 
 		 372 aa  133  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  32.07 
 
 		 359 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  29.44 
 
 		 368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6044  alanine racemase domain-containing protein  31.87 
 
 		 359 aa  124  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  28.32 
 
 		 374 aa  123  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4817  alanine racemase-like  29.36 
 
 		 380 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  31.23 
 
 		 360 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  28.42 
 
 		 396 aa  112  9e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1749  alanine racemase domain protein  28.57 
 
 		 360 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  27.2 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3698  alanine racemase domain-containing protein  28.15 
 
 		 393 aa  109  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836905  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1026  alanine racemase domain protein  25.34 
 
 		 370 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.129179  normal  0.48219 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  29.55 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0977  alanine racemase-like  25.59 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.785974  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  24.53 
 
 		 375 aa  100  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5969  alanine racemase domain-containing protein  27.15 
 
 		 393 aa  100  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1147  alanine racemase domain protein  27.37 
 
 		 382 aa  99.4  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3125  alanine racemase domain protein  26.61 
 
 		 393 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682983  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3086  hypothetical protein  27.44 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2026  metal-activated pyridoxal protein  27.84 
 
 		 379 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0507095 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2770  amino acid aldolase or racemase-like  26.65 
 
 		 394 aa  97.1  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.873448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1815  D-serine deaminase  27.27 
 
 		 399 aa  97.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2109  hypothetical protein  28.34 
 
 		 383 aa  97.1  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3007  D-amino acid deaminase  25.34 
 
 		 417 aa  96.3  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.675457  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  25.72 
 
 		 378 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0971  alanine racemase domain-containing protein  27.09 
 
 		 380 aa  94  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2565  alanine racemase domain protein  28.84 
 
 		 364 aa  93.2  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6194  alanine racemase domain protein  28.09 
 
 		 384 aa  92.8  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1427  hypothetical protein  27.84 
 
 		 421 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.520703  normal  0.295822 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2709  hypothetical protein  24.87 
 
 		 376 aa  91.3  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  26.19 
 
 		 376 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0721  alanine racemase domain protein  27.9 
 
 		 444 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.06158 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  26.96 
 
 		 376 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  24.93 
 
 		 375 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1031  putative D-amino acid deaminase  27.3 
 
 		 447 aa  89.7  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.710542  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1553  hypothetical protein  26 
 
 		 369 aa  89.7  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3951  alanine racemase domain-containing protein  24.41 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274833 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0462  alanine racemase-like  28.39 
 
 		 393 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5145  hypothetical protein  26.51 
 
 		 416 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04610  predicted amino acid aldolase or racemase  24.53 
 
 		 419 aa  87.4  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4759  hypothetical protein  26.67 
 
 		 416 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117836  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4845  hypothetical protein  26.67 
 
 		 416 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.44588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0549  hypothetical protein  25.73 
 
 		 413 aa  86.3  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2781  hypothetical protein  25.2 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0671  alanine racemase domain-containing protein  21.04 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5361  hypothetical protein  25.21 
 
 		 425 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5822  alanine racemase domain protein  27.27 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.608678 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2509  hypothetical protein  25.65 
 
 		 401 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.517635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2432  hypothetical protein  26.11 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000194149  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2252  alanine racemase domain protein  22.53 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0726647  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2011  hypothetical protein  26.5 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.51846  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0557  amino acid aldolase or racemase-like protein  24.93 
 
 		 426 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0086  D-serine deaminase  26.18 
 
 		 427 aa  79.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.01292 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4307  alanine racemase domain protein  23.93 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438666  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>