More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2646 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 771 aa  1570    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  44.24 
 
 		 802 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  42.12 
 
 		 753 aa  538  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  40.22 
 
 		 847 aa  512  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  31.57 
 
 		 763 aa  333  5e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 742 aa  317  4e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 747 aa  287  7e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 		 712 aa  281  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 777 aa  280  6e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 795 aa  280  8e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 792 aa  277  6e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 757 aa  273  9e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  30.85 
 
 		 777 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 786 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  30.15 
 
 		 784 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  29.34 
 
 		 785 aa  268  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 807 aa  266  7e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 762 aa  265  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  30.18 
 
 		 822 aa  263  8.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  28.81 
 
 		 889 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 808 aa  254  5.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 788 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 780 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 781 aa  245  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 752 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 780 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 734 aa  244  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 806 aa  241  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 802 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 795 aa  238  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 808 aa  238  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 766 aa  232  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 797 aa  229  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 795 aa  226  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  28.66 
 
 		 804 aa  218  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0767  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 883 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000108797  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 791 aa  218  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  27.31 
 
 		 856 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 798 aa  214  5.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 720 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 753 aa  207  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 766 aa  204  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 724 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  25.31 
 
 		 846 aa  198  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 764 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1050  TonB-dependent receptor, plug  24.77 
 
 		 830 aa  195  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.908027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 790 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  26.15 
 
 		 715 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 730 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 704 aa  189  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 853 aa  187  8e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 780 aa  187  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 851 aa  185  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 713 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 765 aa  184  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 761 aa  184  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 713 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 730 aa  181  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 777 aa  179  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  26.09 
 
 		 739 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 817 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2726  TonB-dependent receptor plug  26.78 
 
 		 829 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.298925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 702 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 775 aa  176  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 761 aa  174  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 747 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.27 
 
 		 695 aa  173  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 778 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 710 aa  172  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 875 aa  169  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 723 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 741 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 761 aa  167  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 792 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 794 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 732 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0968  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 709 aa  164  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 720 aa  164  8.000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 808 aa  163  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 784 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 784 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 787 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 767 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 755 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 700 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 778 aa  157  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 728 aa  155  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 748 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 744 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 757 aa  155  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 796 aa  153  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 773 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 746 aa  152  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 722 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4008  TonB-dependent receptor plug  33.77 
 
 		 365 aa  152  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 779 aa  150  9e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 785 aa  150  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 785 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 731 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 814 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>