More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4007 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4007  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 389 aa  781    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.413023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  54.5 
 
 		 766 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 		 753 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 777 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  30.28 
 
 		 856 aa  116  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  29.12 
 
 		 822 aa  116  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  28.69 
 
 		 771 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 802 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 734 aa  110  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  28.49 
 
 		 846 aa  109  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0767  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 883 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000108797  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 795 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 747 aa  106  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 792 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 808 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 757 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  27.79 
 
 		 784 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 791 aa  100  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 807 aa  97.8  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 786 aa  95.9  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 763 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 724 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 752 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 763 aa  93.2  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  28.61 
 
 		 797 aa  92.8  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 778 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 742 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 741 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 775 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 795 aa  91.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  28.88 
 
 		 785 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 780 aa  90.5  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 720 aa  90.5  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 822 aa  90.1  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 778 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02386  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 886 aa  89  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00704542  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  27.15 
 
 		 889 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  34.86 
 
 		 807 aa  88.6  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 732 aa  87.4  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 743 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 762 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 795 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 780 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 781 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  32.86 
 
 		 761 aa  84.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 761 aa  84.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 806 aa  83.6  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 755 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  27.84 
 
 		 715 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 790 aa  83.2  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0968  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 709 aa  83.2  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1050  TonB-dependent receptor, plug  27.23 
 
 		 830 aa  82.8  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.908027 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 777 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 790 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 773 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  29.48 
 
 		 759 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 774 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 751 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 790 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 780 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  26.33 
 
 		 739 aa  80.1  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 790 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 712 aa  79.7  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 792 aa  79.7  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 743 aa  79.7  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 753 aa  79.7  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 737 aa  79.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 767 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 776 aa  78.2  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 786 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 754 aa  79  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 798 aa  77.8  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 736 aa  78.2  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 730 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 763 aa  77.8  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3419  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 358 aa  77.4  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.158258 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 771 aa  77.4  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 757 aa  77.4  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  32.45 
 
 		 730 aa  76.6  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 796 aa  76.6  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 773 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 761 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 771 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 749 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 720 aa  75.1  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 817 aa  74.7  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 782 aa  74.7  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 802 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 758 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 788 aa  73.9  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 758 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 713 aa  73.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 859 aa  73.6  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 797 aa  73.2  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 780 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 803 aa  72.8  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 743 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 795 aa  72.8  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1066  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 844 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308413  normal  0.134897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 809 aa  72  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>