More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0150 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 872 aa  1790    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  57.9 
 
 		 793 aa  937    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09768  putative outer membrane protein  55.56 
 
 		 780 aa  892    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.990428  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  50.13 
 
 		 790 aa  818    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  53.38 
 
 		 791 aa  875    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  40.05 
 
 		 775 aa  589  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  40.31 
 
 		 792 aa  568  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  40.44 
 
 		 800 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3569  TonB-dependent receptor  39.57 
 
 		 787 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557391  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  39.1 
 
 		 772 aa  561  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  40.2 
 
 		 814 aa  562  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4389  TonB-dependent receptor plug  38.17 
 
 		 775 aa  551  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0212821 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  35.93 
 
 		 881 aa  542  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  36.62 
 
 		 791 aa  526  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  33.83 
 
 		 923 aa  525  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  37.32 
 
 		 923 aa  515  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2829  TonB-dependent receptor plug  36.74 
 
 		 803 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1438  TonB-dependent receptor, plug  35.04 
 
 		 928 aa  458  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0030  TonB-dependent receptor plug  35.03 
 
 		 786 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  31.52 
 
 		 917 aa  439  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  32.04 
 
 		 806 aa  396  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4371  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 874 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000169571  normal  0.0339201 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0255  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 852 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.786505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2914  TonB-dependent receptor plug  30.11 
 
 		 800 aa  386  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0667343  normal  0.659608 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 789 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  30.01 
 
 		 875 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5733  TonB-dependent receptor plug  32.48 
 
 		 804 aa  376  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0884503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  30.72 
 
 		 772 aa  357  5.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  28.36 
 
 		 753 aa  288  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1696  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 756 aa  253  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  25.28 
 
 		 888 aa  232  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  27.89 
 
 		 831 aa  154  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  21.84 
 
 		 859 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2316  hypothetical protein  20.55 
 
 		 866 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.824305  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  22.99 
 
 		 865 aa  115  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  30.03 
 
 		 821 aa  105  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  24.17 
 
 		 906 aa  102  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  21.76 
 
 		 860 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  23.36 
 
 		 791 aa  98.6  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  22.79 
 
 		 1148 aa  97.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0684  putative TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 701 aa  96.3  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  26.71 
 
 		 779 aa  96.3  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 814 aa  96.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  22.29 
 
 		 859 aa  92.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  25.21 
 
 		 897 aa  92  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  24.64 
 
 		 1109 aa  91.7  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  25.58 
 
 		 822 aa  91.3  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  25.78 
 
 		 1102 aa  89  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  23.93 
 
 		 771 aa  89  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  25.66 
 
 		 1173 aa  87.4  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  23.55 
 
 		 1168 aa  87.4  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 1128 aa  86.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  27.38 
 
 		 1119 aa  86.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 1144 aa  85.5  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  25.21 
 
 		 1114 aa  85.1  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 1083 aa  83.2  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  22.88 
 
 		 1106 aa  82  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1075 aa  81.6  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  24.03 
 
 		 1163 aa  80.9  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 866 aa  80.9  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  22.12 
 
 		 1148 aa  80.1  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  23.74 
 
 		 1116 aa  80.1  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0118  TonB-dependent receptor, plug  29.58 
 
 		 821 aa  78.6  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 882 aa  79  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  23.84 
 
 		 767 aa  79  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  26.8 
 
 		 1153 aa  79  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  24.25 
 
 		 1150 aa  78.6  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 1175 aa  78.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 		 1164 aa  78.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 1094 aa  78.6  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1606  hypothetical protein  24.32 
 
 		 802 aa  77.8  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00919182  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  21.9 
 
 		 1155 aa  77.8  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 1028 aa  77.4  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0287  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  21.09 
 
 		 714 aa  77.4  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000460019  hitchhiker  0.00000346512 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  23.02 
 
 		 1127 aa  77  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  23.09 
 
 		 719 aa  77  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  23.57 
 
 		 1145 aa  77  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  24.31 
 
 		 827 aa  76.3  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01505  putative TonB-dependent transmembrane receptor protein  25.56 
 
 		 803 aa  77  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 1090 aa  76.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  25.57 
 
 		 1138 aa  76.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  25.09 
 
 		 1190 aa  76.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  22.48 
 
 		 1202 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  24.56 
 
 		 1186 aa  75.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 897 aa  75.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  21.87 
 
 		 1140 aa  75.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  24.3 
 
 		 1169 aa  75.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  21.93 
 
 		 1128 aa  75.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  23.74 
 
 		 1177 aa  75.5  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  25.26 
 
 		 1138 aa  75.5  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  23.78 
 
 		 1146 aa  75.5  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  20.36 
 
 		 1132 aa  75.1  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2376  TonB-dependent receptor plug  24.16 
 
 		 797 aa  75.1  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.7024  normal  0.460904 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  22.43 
 
 		 1165 aa  75.1  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  24.37 
 
 		 1129 aa  74.7  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  20.83 
 
 		 902 aa  73.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  23.98 
 
 		 1142 aa  73.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  28.18 
 
 		 730 aa  73.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  31.62 
 
 		 1023 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  21.94 
 
 		 1103 aa  73.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>