More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0657 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  100 
 
 
666 aa  1322    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  44.76 
 
 
670 aa  578  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 
853 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 
851 aa  232  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  31.21 
 
 
720 aa  228  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 
695 aa  226  1e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  28.31 
 
 
715 aa  224  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.45 
 
 
685 aa  200  7e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1458  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 
694 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.552636  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 
690 aa  197  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 
687 aa  195  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0007  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 
641 aa  192  1e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 
690 aa  191  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 
761 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 
713 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  28.1 
 
 
695 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 
700 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3046  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 
722 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.770987  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 
720 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 
751 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4085  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 
685 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.141893  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0231  TonB-dependent siderophore receptor  26.54 
 
 
771 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 
726 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  26.86 
 
 
759 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 
749 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 
753 aa  167  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 
728 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 
771 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 
704 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 
724 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 
732 aa  160  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 
710 aa  160  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2093  yersiniabactin/pesticin receptor FyuA  27.79 
 
 
673 aa  160  7e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 
763 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 
736 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 
761 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 
713 aa  157  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 
736 aa  157  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1807  putative siderophore receptor protein  28.95 
 
 
691 aa  156  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0597664 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 
730 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 
743 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 
722 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 
680 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 
788 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 
726 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 
764 aa  152  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 
713 aa  151  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 
737 aa  150  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 
755 aa  151  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 
745 aa  150  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 
734 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 
733 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 
748 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 
722 aa  147  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 
757 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2312  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 
719 aa  146  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00576546  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 
712 aa  146  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 
725 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 
790 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 
732 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1486  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 
693 aa  145  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643669  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 
728 aa  145  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 
761 aa  145  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 
702 aa  144  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 
713 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 
779 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 
712 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 
743 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3007  TonB-dependent siderophore receptor  26.53 
 
 
692 aa  141  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0304198  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 
780 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 
732 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1660  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 
729 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000750921  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 
758 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 
755 aa  140  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 
717 aa  140  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 
730 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  25.75 
 
 
754 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 
746 aa  139  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1802  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 
743 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 
723 aa  139  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 
744 aa  138  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000583553  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.24 
 
 
755 aa  137  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 
775 aa  137  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2484  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 
744 aa  137  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000223864  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3527  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 
694 aa  137  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 
794 aa  136  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 
780 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1400  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 
678 aa  136  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  25 
 
 
792 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 
766 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 
759 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 
732 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  23.09 
 
 
729 aa  135  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1436  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 
669 aa  134  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0067  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 
726 aa  134  7.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0838  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 
671 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 
741 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 
686 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2715  TonB-dependent receptor  22.38 
 
 
733 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 
720 aa  132  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>