More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2711 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2711  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 762 aa  1572    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.882237  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2701  TonB-dependent receptor, plug  30 
 
 		 822 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3332  Outer membrane receptor proteins mostly Fe transport-like  25.52 
 
 		 744 aa  208  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0148942 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 703 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 753 aa  161  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 734 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 765 aa  156  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 747 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 723 aa  153  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  24.44 
 
 		 776 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 783 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 713 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 762 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  23.07 
 
 		 783 aa  145  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 758 aa  145  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  24.25 
 
 		 741 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 790 aa  142  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 766 aa  140  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 729 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 769 aa  140  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 771 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 717 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 758 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 731 aa  138  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 773 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 798 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  23.29 
 
 		 755 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 773 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  23.6 
 
 		 695 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 700 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  23.31 
 
 		 741 aa  134  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 802 aa  134  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 704 aa  130  7.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 720 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 		 798 aa  130  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 761 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 718 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 738 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 778 aa  129  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 		 771 aa  129  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 758 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  22.72 
 
 		 800 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  22.72 
 
 		 800 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 755 aa  128  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 730 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 702 aa  125  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 803 aa  125  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2337  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 741 aa  124  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 730 aa  124  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3344  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 791 aa  123  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 763 aa  123  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  24.3 
 
 		 797 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 		 726 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 755 aa  123  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2440  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 688 aa  121  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0489256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  23.62 
 
 		 759 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  22.63 
 
 		 778 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 761 aa  121  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  22.3 
 
 		 780 aa  120  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 774 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 758 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 744 aa  120  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  22.04 
 
 		 715 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 720 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 758 aa  119  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 758 aa  119  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 743 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1059  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 777 aa  118  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000502668  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  22.21 
 
 		 807 aa  117  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 713 aa  117  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 		 730 aa  117  8.999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 732 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 746 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  21.14 
 
 		 728 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  21.77 
 
 		 788 aa  115  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 786 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 791 aa  115  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  22.86 
 
 		 751 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 777 aa  114  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 786 aa  114  8.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 753 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 787 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 786 aa  112  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 755 aa  112  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 767 aa  112  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1499  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 		 649 aa  111  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.378064  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 750 aa  111  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 		 781 aa  111  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0667  putative TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 793 aa  111  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 771 aa  111  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 780 aa  111  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 776 aa  110  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0886  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 806 aa  110  9.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0016588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 790 aa  110  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  22.27 
 
 		 757 aa  110  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 856 aa  110  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 790 aa  110  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 761 aa  109  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 795 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 		 783 aa  108  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>