More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3048 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3048  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1220 aa  2501    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  28.71 
 
 		 1219 aa  465  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  29.11 
 
 		 1219 aa  426  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  28.87 
 
 		 1114 aa  419  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1734  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1136 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  28.49 
 
 		 1135 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  28.75 
 
 		 1237 aa  381  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4781  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1119 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000704544  hitchhiker  0.00536077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2947  TonB-dependent receptor plug  27.47 
 
 		 1161 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.594997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6155  TonB-dependent receptor plug  28.49 
 
 		 1229 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.597613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5342  TonB-dependent receptor plug  28.72 
 
 		 1203 aa  373  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135995  normal  0.0211304 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 1181 aa  338  3.9999999999999995e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  27.07 
 
 		 1111 aa  335  4e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2671  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 1202 aa  330  8e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000367152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4497  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 1198 aa  317  7e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452901  normal  0.421044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  26.27 
 
 		 1205 aa  310  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  25.53 
 
 		 1086 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  26.74 
 
 		 1129 aa  301  6e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3945  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 1189 aa  300  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1074  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 1190 aa  297  7e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240766  normal  0.107047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  25.69 
 
 		 1155 aa  296  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  24.98 
 
 		 1211 aa  296  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 1154 aa  295  4e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  26.34 
 
 		 1124 aa  294  6e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  24.92 
 
 		 1116 aa  287  7e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 1140 aa  280  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1991  TonB-dependent receptor plug  25.46 
 
 		 1187 aa  279  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694005  hitchhiker  0.000163482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0058  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 1185 aa  279  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  26.41 
 
 		 1089 aa  277  7e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  24.94 
 
 		 1177 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0950  TonB-dependent receptor plug  25.42 
 
 		 1199 aa  275  4.0000000000000004e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00543932  normal  0.368502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  25.68 
 
 		 1113 aa  274  6e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 1119 aa  274  7e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  26.33 
 
 		 1066 aa  274  8.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  25.3 
 
 		 1132 aa  273  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 1037 aa  273  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  26.1 
 
 		 1161 aa  273  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  25.82 
 
 		 1127 aa  271  4e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6427  TonB-dependent receptor plug  26 
 
 		 1101 aa  271  5.9999999999999995e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6148  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 1218 aa  268  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  25.84 
 
 		 997 aa  268  5.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3996  TonB-dependent receptor plug  23.76 
 
 		 1204 aa  267  8.999999999999999e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5113  TonB-dependent receptor plug  25.24 
 
 		 1102 aa  265  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298267  normal  0.131345 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  24.64 
 
 		 1154 aa  264  8e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1800  TonB-dependent receptor plug  25.26 
 
 		 1127 aa  263  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000499096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  24.86 
 
 		 1113 aa  261  4e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  25.02 
 
 		 1147 aa  260  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5147  TonB-dependent receptor plug  25.04 
 
 		 1164 aa  260  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0557034  normal  0.0156539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  24.87 
 
 		 1062 aa  258  5e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  26.14 
 
 		 1163 aa  258  6e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  27.01 
 
 		 1023 aa  258  7e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  26.04 
 
 		 925 aa  257  9e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  26.43 
 
 		 1023 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 996 aa  256  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  25.95 
 
 		 999 aa  255  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  26.84 
 
 		 1076 aa  255  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  24.94 
 
 		 1117 aa  253  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 1029 aa  253  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  24.27 
 
 		 1128 aa  253  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  25.48 
 
 		 1154 aa  253  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 1076 aa  252  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 1010 aa  252  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  25.74 
 
 		 1109 aa  251  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1354  TonB-dependent receptor plug  23 
 
 		 1230 aa  251  8e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  25.36 
 
 		 1039 aa  250  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0973  TonB-dependent receptor plug  26.04 
 
 		 1109 aa  250  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  25.21 
 
 		 1096 aa  249  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  26.49 
 
 		 1028 aa  249  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  25.61 
 
 		 1023 aa  249  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 994 aa  249  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  25.08 
 
 		 1102 aa  249  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  26.08 
 
 		 1027 aa  248  6e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  24.69 
 
 		 1051 aa  246  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  24.45 
 
 		 1143 aa  247  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  26.51 
 
 		 1034 aa  246  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  24.75 
 
 		 1077 aa  243  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  23.57 
 
 		 1177 aa  243  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  27.06 
 
 		 1137 aa  242  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  26.2 
 
 		 1192 aa  241  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  24.67 
 
 		 1150 aa  240  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  24.71 
 
 		 1008 aa  239  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  24.96 
 
 		 1038 aa  239  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  26.48 
 
 		 1075 aa  239  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2264  TonB-dependent receptor plug  24.2 
 
 		 1175 aa  238  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.403047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 1094 aa  236  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  25.31 
 
 		 1066 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  25.56 
 
 		 1116 aa  236  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  23.59 
 
 		 1114 aa  236  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  26.64 
 
 		 1060 aa  234  6e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 		 1168 aa  234  8.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  25.76 
 
 		 1041 aa  233  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 1189 aa  233  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  25.7 
 
 		 1084 aa  232  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  25.44 
 
 		 1076 aa  232  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  25.18 
 
 		 1019 aa  232  4e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  25.54 
 
 		 1123 aa  232  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  30.74 
 
 		 1146 aa  231  5e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  25.63 
 
 		 1053 aa  231  7e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  24.78 
 
 		 1020 aa  231  8e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  24.73 
 
 		 1006 aa  231  8e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>