93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI00380 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006694  CNI00380  expressed protein  100 
 
 
419 aa  868    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35359  predicted protein  39.39 
 
 
424 aa  325  1e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63574  predicted protein  37.82 
 
 
424 aa  293  4e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07140  conserved hypothetical protein  34.88 
 
 
414 aa  236  5.0000000000000005e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.20152 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2109  hypothetical protein  31.25 
 
 
383 aa  147  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.456028  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0977  alanine racemase-like  30.1 
 
 
379 aa  146  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.785974  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4817  alanine racemase-like  30.52 
 
 
380 aa  140  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2026  metal-activated pyridoxal protein  29.56 
 
 
379 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0507095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3125  alanine racemase domain protein  28.89 
 
 
393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.682983  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5303  alanine racemase domain-containing protein  26.75 
 
 
376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728063  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0070  alanine racemase domain protein  29.63 
 
 
396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3569  alanine racemase domain-containing protein  27.25 
 
 
375 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.463825  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3951  alanine racemase domain-containing protein  27 
 
 
376 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274833 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3484  alanine racemase domain-containing protein  26.5 
 
 
376 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230259  normal  0.0513878 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2252  alanine racemase domain protein  28.04 
 
 
380 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0726647  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3698  alanine racemase domain-containing protein  30.27 
 
 
393 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.836905  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3640  hypothetical protein  26.93 
 
 
378 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3398  alanine racemase, N-terminal  26 
 
 
378 aa  123  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000409999  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2709  hypothetical protein  27.05 
 
 
376 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5822  alanine racemase domain protein  29.26 
 
 
355 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.608678 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1147  alanine racemase domain protein  28.47 
 
 
382 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2558  alanine racemase domain protein  26.75 
 
 
380 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.442007  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5969  alanine racemase domain-containing protein  27.92 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.463458  normal  0.115388 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2554  alanine racemase-like  27.2 
 
 
359 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.686236 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0462  alanine racemase-like  27.87 
 
 
393 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2565  alanine racemase domain protein  29.8 
 
 
364 aa  113  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6194  alanine racemase domain protein  27.61 
 
 
384 aa  113  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1609  alanine racemase domain-containing protein  26.13 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00354322  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0971  alanine racemase domain-containing protein  27.11 
 
 
380 aa  106  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  29.19 
 
 
372 aa  102  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3891  alanine racemase domain-containing protein  27.37 
 
 
354 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6243  hypothetical protein  26.22 
 
 
366 aa  98.2  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  25.94 
 
 
386 aa  98.6  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  27.53 
 
 
355 aa  98.2  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  27.53 
 
 
355 aa  98.2  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0405  putative GlnD family protein  24.68 
 
 
368 aa  94.7  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04740  predicted amino acid aldolase or racemase  28.36 
 
 
371 aa  94.7  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17439  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2689  alanine racemase domain-containing protein  26.65 
 
 
360 aa  92  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0778571  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  25.06 
 
 
352 aa  92  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  25 
 
 
359 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5683  alanine racemase domain protein  26.89 
 
 
366 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1749  alanine racemase domain protein  28.12 
 
 
360 aa  81.3  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6626  alanine racemase domain protein  27.79 
 
 
366 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0759064  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3203  alanine racemase-like  25.53 
 
 
360 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  24.94 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2252  alanine racemase-like  26.6 
 
 
360 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0463  alanine racemase-like  25.59 
 
 
356 aa  75.1  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0404  alanine racemase domain protein  25.98 
 
 
380 aa  73.2  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2752  alanine racemase-like  24.32 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0421965  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1933  alanine racemase domain protein  25.12 
 
 
362 aa  67.4  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  29.7 
 
 
381 aa  67  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4367  D-3-hydroxyaspartate aldolase  23.1 
 
 
387 aa  64.3  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  24.78 
 
 
359 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4234  putative threonine aldolase  27.05 
 
 
392 aa  63.5  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.970964  normal  0.201076 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  22.47 
 
 
384 aa  63.5  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  24.3 
 
 
349 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2701  D-3-hydroxyaspartate aldolase  23.25 
 
 
387 aa  62.4  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.75052  normal  0.463179 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  24.03 
 
 
349 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  29.27 
 
 
383 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  22 
 
 
383 aa  62.4  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  25.97 
 
 
400 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.87338 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  19.9 
 
 
376 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  24.94 
 
 
371 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  19.85 
 
 
376 aa  61.6  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  22.08 
 
 
387 aa  60.5  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  21.34 
 
 
373 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2604  D-3-hydroxyaspartate aldolase  21.47 
 
 
387 aa  57.8  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00289104  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0889  alanine racemase domain protein  22.64 
 
 
387 aa  57.4  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0671  alanine racemase domain-containing protein  22.25 
 
 
371 aa  57  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6044  alanine racemase domain-containing protein  23.28 
 
 
359 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  21.57 
 
 
388 aa  56.2  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  28.65 
 
 
371 aa  56.2  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  21.65 
 
 
392 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3175  threonine aldolase family protein  28.82 
 
 
381 aa  53.9  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  30.63 
 
 
372 aa  53.1  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  23.21 
 
 
374 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  26.58 
 
 
372 aa  51.2  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4878  alanine racemase domain protein  31.48 
 
 
386 aa  50.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.437822  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  27.71 
 
 
383 aa  50.1  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6070  amino acid aldolase or racemase-like  21.8 
 
 
426 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1219  alanine racemase domain protein  20.15 
 
 
437 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4194  amino acid processing enzyme (aldolase or racemase)  38.89 
 
 
382 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485088  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1185  D-serine deaminase  23.67 
 
 
425 aa  47.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4887  putative threonine aldolase  22.73 
 
 
382 aa  47  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0501  alanine racemase domain protein  28.12 
 
 
393 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0490  alanine racemase domain-containing protein  28.75 
 
 
393 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502402  normal  0.091629 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  32.22 
 
 
381 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  23.04 
 
 
391 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4307  alanine racemase domain protein  22.87 
 
 
425 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438666  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4197  putative D-serine deaminase (D-serine dehydratase) protein  22.87 
 
 
425 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3855  alanine racemase domain protein  24.34 
 
 
397 aa  43.9  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.842068  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  22.58 
 
 
391 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0422  alanine racemase domain protein  21.68 
 
 
375 aa  43.1  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.25144 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>