70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3855 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3855  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 397 aa  787    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.842068  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5489  alanine racemase domain protein  68.84 
 
 		 407 aa  513  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.525884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2357  hypothetical protein  67.25 
 
 		 401 aa  499  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0956  alanine racemase domain-containing protein  67 
 
 		 391 aa  487  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0410  alanine racemase domain protein  64.62 
 
 		 415 aa  481  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1751  amino acid aldolase or racemase-like protein  64.91 
 
 		 397 aa  467  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.292148 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4702  alanine racemase domain protein  61.16 
 
 		 444 aa  456  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0031  alanine racemase domain protein  58.84 
 
 		 395 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0845  alanine racemase domain-containing protein  55.56 
 
 		 403 aa  410  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00520  predicted amino acid aldolase or racemase  59.34 
 
 		 393 aa  388  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4024  hypothetical protein  58.44 
 
 		 427 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1282  alanine racemase domain protein  53.06 
 
 		 419 aa  381  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4405  hypothetical protein  57.93 
 
 		 402 aa  375  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.443829  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11797  hypothetical protein  55.42 
 
 		 411 aa  371  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000169265  hitchhiker  0.000017581 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13130  predicted amino acid aldolase or racemase  54.64 
 
 		 403 aa  365  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709051  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1898  alanine racemase domain protein  54.41 
 
 		 407 aa  361  1e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107111  decreased coverage  0.00000153427 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2456  hypothetical protein  51.56 
 
 		 411 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.146397  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2954  alanine racemase domain protein  52.97 
 
 		 400 aa  348  6e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1520  alanine racemase domain protein  50.25 
 
 		 438 aa  343  2.9999999999999997e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.231504  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0670  alanine racemase domain protein  54.08 
 
 		 411 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3007  amino acid aldolase or racemase-like  50.26 
 
 		 408 aa  333  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.176851 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31760  predicted amino acid aldolase or racemase  52.1 
 
 		 402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.316259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0593  hypothetical protein  40.84 
 
 		 390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0743387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4627  hypothetical protein  41.36 
 
 		 390 aa  315  9e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.155569  hitchhiker  0.000000000168185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0709  hypothetical protein  41.1 
 
 		 390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0679  hypothetical protein  41.36 
 
 		 390 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.155622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0645  hypothetical protein  41.36 
 
 		 390 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0589  hypothetical protein  41.36 
 
 		 390 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0190436  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0569  hypothetical protein  40.05 
 
 		 390 aa  310  4e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.913627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0734  hypothetical protein  41.1 
 
 		 390 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.02207e-31 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0590  hypothetical protein  41.1 
 
 		 390 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0746  hypothetical protein  41.36 
 
 		 402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0806  hypothetical protein  40.84 
 
 		 390 aa  306  6e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0948809  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1083  amino acid aldolase or racemase-like protein  33.94 
 
 		 345 aa  199  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225982 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5224  hypothetical protein  26.18 
 
 		 388 aa  76.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3936  alanine racemase domain-containing protein  27.98 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6102  hypothetical protein  25.25 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0093  alanine racemase domain-containing protein  26.34 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70310  hypothetical protein  24.5 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2444  hypothetical protein  23.05 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3378  alanine racemase domain-containing protein  26.32 
 
 		 372 aa  59.7  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0725175  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0743  amino acid processing enzyme-related protein  27.65 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44305  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2681  alanine racemase domain-containing protein  26.18 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0694  amino acid processing enzyme-related protein  27.65 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.296447  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2495  alanine racemase-like  23.47 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.453866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4875  alanine racemase domain protein  24.37 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2236  alanine racemase domain protein  25.85 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3403  alanine racemase domain protein  27.91 
 
 		 383 aa  56.2  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4819  D-3-hydroxyaspartate aldolase  27.76 
 
 		 371 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2590  hypothetical protein  23.05 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1540  alanine racemase domain-containing protein  24.91 
 
 		 373 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0157417  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2914  alanine racemase domain protein  25.07 
 
 		 374 aa  53.9  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0179  alanine racemase domain protein  27.99 
 
 		 372 aa  53.5  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1415  alanine racemase domain-containing protein  27.17 
 
 		 386 aa  53.1  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1390  D-3-hydroxyaspartate aldolase  25 
 
 		 383 aa  53.1  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.940075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3864  alanine racemase domain-containing protein  26.03 
 
 		 349 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791347  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0329  low-specificity D-threonine aldolase  31.11 
 
 		 372 aa  52.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0513  putative threonine aldolase  24.74 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0979  alanine racemase-like  24.62 
 
 		 384 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.638732  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4362  alanine racemase domain-containing protein  26.6 
 
 		 380 aa  50.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0554  alanine racemase domain-containing protein  27.3 
 
 		 349 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3590  putative amino acid processing enzyme-related protein (aldolase or racemase)  26.97 
 
 		 359 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00954952 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3310  alanine racemase-like  24.62 
 
 		 388 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.259344  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6208  alanine racemase domain-containing protein  27.07 
 
 		 392 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0582521 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4545  alanine racemase domain-containing protein  28.96 
 
 		 352 aa  47  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7240  alanine racemase domain protein  29.66 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3919  alanine racemase domain-containing protein  23.6 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.435756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0614  alanine racemase domain-containing protein  26.54 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.605452  normal  0.988857 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00380  expressed protein  24.34 
 
 		 419 aa  43.5  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4092  putative threonine aldolase  26.09 
 
 		 400 aa  42.7  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.87338 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>