More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2321 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  61.22 
 
 		 730 aa  941    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2715  TonB-dependent receptor  66.9 
 
 		 733 aa  957    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  64.58 
 
 		 744 aa  978    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000583553  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1660  TonB-dependent receptor  65.95 
 
 		 729 aa  945    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000750921  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  64.58 
 
 		 743 aa  979    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1802  TonB-dependent receptor  64.44 
 
 		 743 aa  978    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2321  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 744 aa  1531    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.130994  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  61.71 
 
 		 713 aa  942    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  61.38 
 
 		 729 aa  947    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  68.24 
 
 		 757 aa  1067    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2484  TonB-dependent receptor  65.95 
 
 		 744 aa  966    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000223864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  64.9 
 
 		 732 aa  985    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  68.24 
 
 		 748 aa  1069    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  68.12 
 
 		 733 aa  1046    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  63.56 
 
 		 712 aa  970    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  63.09 
 
 		 736 aa  961    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  38.79 
 
 		 697 aa  483  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0067  TonB-dependent receptor  37.12 
 
 		 726 aa  474  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3405  outer membrane protein  33.25 
 
 		 714 aa  389  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.411389  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1344  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 		 687 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341297  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02805  TonB-dependent receptor  32.07 
 
 		 696 aa  336  7.999999999999999e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00354555  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 851 aa  221  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 853 aa  221  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 690 aa  201  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 690 aa  201  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 720 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  26.45 
 
 		 715 aa  192  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 729 aa  183  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 783 aa  177  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  24.19 
 
 		 695 aa  177  8e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 687 aa  174  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 695 aa  171  4e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 713 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 728 aa  164  7e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 764 aa  164  8.000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 761 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  24.71 
 
 		 767 aa  161  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 720 aa  161  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 765 aa  160  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 773 aa  158  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 790 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 747 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 771 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 755 aa  153  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 803 aa  153  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 773 aa  152  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 761 aa  151  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  22.96 
 
 		 732 aa  150  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 741 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 762 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  25.77 
 
 		 759 aa  149  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 704 aa  145  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 792 aa  144  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  24.46 
 
 		 755 aa  143  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1458  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 694 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.552636  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 703 aa  140  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0007  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 641 aa  140  6e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 763 aa  140  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 769 aa  140  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 794 aa  139  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 778 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 798 aa  139  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 775 aa  139  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 766 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 802 aa  137  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 741 aa  137  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 734 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 702 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 761 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2695  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 711 aa  134  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 758 aa  134  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 759 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 750 aa  133  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 778 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 763 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 761 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 758 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 743 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 738 aa  133  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 749 aa  132  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 686 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 794 aa  131  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 722 aa  131  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 795 aa  130  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 732 aa  130  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 758 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 700 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 712 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  22.76 
 
 		 666 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 751 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7293  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 835 aa  129  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 753 aa  129  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 753 aa  128  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  24.45 
 
 		 739 aa  128  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 736 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 777 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 758 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1486  TonB-dependent receptor  22.42 
 
 		 693 aa  127  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 733 aa  128  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 758 aa  127  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>