More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0865 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 720 aa  1479    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  40.75 
 
 		 690 aa  510  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  40.6 
 
 		 690 aa  503  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  30.86 
 
 		 715 aa  299  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 853 aa  296  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 851 aa  295  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 687 aa  281  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.76 
 
 		 695 aa  253  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 704 aa  243  7.999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 695 aa  230  6e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 710 aa  230  8e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 666 aa  229  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 753 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 720 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 712 aa  225  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 729 aa  225  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1807  putative siderophore receptor protein  29.56 
 
 		 691 aa  224  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597664 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 697 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 784 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 730 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 686 aa  220  7e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 783 aa  219  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 724 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 730 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 713 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 713 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 734 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 741 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 747 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 728 aa  213  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 700 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 766 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 757 aa  210  9e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1660  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 729 aa  209  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000750921  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 748 aa  209  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 761 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 767 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 733 aa  207  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 		 767 aa  207  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 743 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 736 aa  205  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 732 aa  204  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 732 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 744 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000583553  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2321  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 744 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.130994  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 737 aa  201  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2715  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 733 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2484  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 744 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000223864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 703 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1802  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 743 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 765 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 778 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 764 aa  196  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 803 aa  196  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.57 
 
 		 685 aa  194  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  26.04 
 
 		 739 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 780 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 769 aa  194  5e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 726 aa  194  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 728 aa  194  6e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 751 aa  194  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 774 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 755 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 723 aa  191  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 733 aa  191  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 783 aa  190  7e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 743 aa  190  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 775 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 773 aa  189  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 778 aa  188  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 749 aa  187  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 702 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 763 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 718 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 736 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1458  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 694 aa  185  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.552636  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 743 aa  184  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 722 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 750 aa  184  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0808  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 733 aa  184  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 771 aa  184  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 755 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 732 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 786 aa  182  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 745 aa  182  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1400  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 678 aa  182  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 794 aa  180  8e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 773 aa  180  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 762 aa  180  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 780 aa  180  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 771 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 743 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 729 aa  179  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 732 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 763 aa  178  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 746 aa  178  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 771 aa  178  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3046  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 722 aa  178  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.770987  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0067  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 726 aa  177  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 780 aa  177  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>