150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1526 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  100 
 
 		 479 aa  999    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_002950  PG1512  hypothetical protein  91.24 
 
 		 205 aa  406  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398828 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  43.99 
 
 		 467 aa  370  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  40.7 
 
 		 462 aa  280  3e-74  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  43.52 
 
 		 276 aa  170  7e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  27.82 
 
 		 494 aa  143  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  28.14 
 
 		 480 aa  143  7e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  27.92 
 
 		 480 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  26.64 
 
 		 471 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  27.18 
 
 		 484 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  29.92 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  28.48 
 
 		 462 aa  124  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  27.43 
 
 		 475 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  26.49 
 
 		 477 aa  110  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  26.12 
 
 		 469 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  29.05 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  28.53 
 
 		 508 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  25.7 
 
 		 481 aa  107  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  26.57 
 
 		 423 aa  106  8e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  25.7 
 
 		 509 aa  106  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  26.78 
 
 		 455 aa  103  7e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  25.54 
 
 		 423 aa  101  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  27.49 
 
 		 485 aa  101  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1541  putative transcriptional regulator  24.67 
 
 		 423 aa  98.6  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509332 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  30.28 
 
 		 430 aa  96.3  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  26.08 
 
 		 620 aa  95.5  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0499  hypothetical protein  27.76 
 
 		 314 aa  94  5e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.12041 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0734  hypothetical protein  30.74 
 
 		 322 aa  92.8  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  26.52 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  26.52 
 
 		 403 aa  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  28.71 
 
 		 235 aa  92  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  24.81 
 
 		 422 aa  92.4  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  27.74 
 
 		 502 aa  87.8  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1786  putative transcriptional regulator  24.6 
 
 		 519 aa  87.4  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.323375  hitchhiker  0.00000234079 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  24.87 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  22.22 
 
 		 453 aa  85.9  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  25.62 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  23.42 
 
 		 478 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  25.73 
 
 		 469 aa  85.1  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  28.22 
 
 		 311 aa  83.2  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  27.47 
 
 		 571 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  32.32 
 
 		 485 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  32.83 
 
 		 582 aa  81.3  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  25.3 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  26.69 
 
 		 492 aa  80.9  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  26.09 
 
 		 556 aa  80.5  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2722  putative transcriptional regulator  26.61 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000390444  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  24.79 
 
 		 463 aa  79  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  24.37 
 
 		 582 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  24.49 
 
 		 572 aa  78.2  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  27.09 
 
 		 456 aa  77.4  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  24.09 
 
 		 522 aa  77.4  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  24.94 
 
 		 475 aa  77  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  24.73 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  29.29 
 
 		 483 aa  76.6  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  26.15 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  23.82 
 
 		 526 aa  75.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  24.94 
 
 		 448 aa  75.1  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  43.16 
 
 		 555 aa  74.7  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4927  ATP-dependent DNA helicase recG  29.33 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  27.1 
 
 		 448 aa  73.9  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  24.61 
 
 		 472 aa  73.6  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  24.57 
 
 		 561 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  27.32 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  24.6 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  23.98 
 
 		 467 aa  70.5  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0027  hypothetical protein  23.96 
 
 		 462 aa  69.7  0.0000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  25.8 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  25.86 
 
 		 468 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2458  putative transcriptional regulator  29.8 
 
 		 619 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0168743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  22.01 
 
 		 455 aa  69.3  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  23.4 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0363  divergent AAA ATPase  50 
 
 		 95 aa  67.4  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  25.98 
 
 		 382 aa  67  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  25.07 
 
 		 396 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  24.35 
 
 		 479 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2653  AAA-4 family protein  23.88 
 
 		 470 aa  66.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  23.89 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  29.38 
 
 		 358 aa  66.2  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  23.75 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  25.33 
 
 		 545 aa  65.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  36.73 
 
 		 226 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  25.77 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  26.39 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  25.07 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  24.63 
 
 		 454 aa  63.2  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  25.43 
 
 		 394 aa  62  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 		 606 aa  62.4  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  23.45 
 
 		 548 aa  62.4  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0638  putative transcriptional regulator  23.51 
 
 		 488 aa  62.4  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  23.12 
 
 		 446 aa  62  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  32.76 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  25.68 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0416  filamentation induced by cAMP protein Fic  50 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  24.57 
 
 		 581 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  24.38 
 
 		 459 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1142  putative transcriptional regulator  24.11 
 
 		 462 aa  58.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0435134 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  25.37 
 
 		 634 aa  58.2  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3863  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.64 
 
 		 334 aa  57  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0343511 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0641  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>