More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3945 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3945  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1189 aa  2409    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5342  TonB-dependent receptor plug  41.77 
 
 		 1203 aa  868    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135995  normal  0.0211304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4497  TonB-dependent receptor plug  39.5 
 
 		 1198 aa  809    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452901  normal  0.421044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6148  TonB-dependent receptor plug  33.99 
 
 		 1218 aa  599  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  32.04 
 
 		 1181 aa  522  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2264  TonB-dependent receptor plug  29.68 
 
 		 1175 aa  487  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.403047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1354  TonB-dependent receptor plug  29.88 
 
 		 1230 aa  464  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2008  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 1198 aa  446  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0950  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 1199 aa  442  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00543932  normal  0.368502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0058  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 1185 aa  439  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2947  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 1161 aa  433  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.594997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6155  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 1229 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.597613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1036  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1096 aa  433  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1991  TonB-dependent receptor plug  28.67 
 
 		 1187 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694005  hitchhiker  0.000163482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1074  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 1190 aa  418  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240766  normal  0.107047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2671  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 		 1202 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000367152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2352  TonB-dependent receptor plug  30.05 
 
 		 1085 aa  376  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.456496 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  27.07 
 
 		 1211 aa  359  1.9999999999999998e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  27 
 
 		 1205 aa  341  4e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  26.47 
 
 		 1219 aa  328  5e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  27.95 
 
 		 1111 aa  325  4e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0666  TonB-dependent receptor plug  27.93 
 
 		 1101 aa  320  9e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0721144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3749  TonB-dependent receptor plug  27.14 
 
 		 1135 aa  317  9e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0080305  decreased coverage  0.0015737 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3996  TonB-dependent receptor plug  26.54 
 
 		 1204 aa  316  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 		 1155 aa  315  3.9999999999999997e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  27.04 
 
 		 1237 aa  313  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 1219 aa  307  9.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1734  TonB-dependent receptor plug  26.55 
 
 		 1136 aa  305  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0441  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 1062 aa  295  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 1037 aa  295  5e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3048  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 1220 aa  289  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  26.71 
 
 		 1096 aa  281  7e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  27.08 
 
 		 986 aa  280  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  26.46 
 
 		 1124 aa  279  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  26.95 
 
 		 1023 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  26.44 
 
 		 1114 aa  272  2.9999999999999997e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  25.23 
 
 		 1132 aa  267  8e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  25.58 
 
 		 1028 aa  265  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3148  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 1119 aa  265  4e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 1120 aa  265  4.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  26.36 
 
 		 1006 aa  263  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  25.76 
 
 		 1027 aa  261  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  25.7 
 
 		 1152 aa  257  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 1154 aa  255  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4548  TonB-dependent receptor plug  25.53 
 
 		 1109 aa  254  9.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.106269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2080  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 1158 aa  253  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.301107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  26.79 
 
 		 1106 aa  253  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  25.24 
 
 		 1154 aa  249  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  24.16 
 
 		 1122 aa  247  9e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 1128 aa  246  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  25.26 
 
 		 1049 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  24.19 
 
 		 1181 aa  242  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  25.05 
 
 		 1105 aa  242  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4781  TonB-dependent receptor plug  24.8 
 
 		 1119 aa  240  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000704544  hitchhiker  0.00536077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  23.93 
 
 		 996 aa  239  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 1063 aa  238  6e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  25.57 
 
 		 1173 aa  238  6e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  24.92 
 
 		 1127 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  24.75 
 
 		 925 aa  236  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  25.55 
 
 		 1086 aa  236  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  25.77 
 
 		 1063 aa  236  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 		 1053 aa  233  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 996 aa  233  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 		 1042 aa  233  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  24.27 
 
 		 1125 aa  232  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  26.27 
 
 		 1198 aa  232  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  26.9 
 
 		 1028 aa  232  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 1094 aa  231  7e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  25.76 
 
 		 1035 aa  230  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  25.88 
 
 		 1060 aa  230  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4373  TonB-dependent receptor, plug  25.22 
 
 		 1009 aa  227  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 1014 aa  224  8e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  24.63 
 
 		 1059 aa  224  8e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  25.11 
 
 		 1030 aa  224  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  24.45 
 
 		 1103 aa  223  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  23.62 
 
 		 1119 aa  221  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  24.82 
 
 		 1164 aa  221  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  26 
 
 		 1040 aa  220  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  26 
 
 		 1131 aa  219  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 1012 aa  219  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  25.47 
 
 		 1034 aa  218  8e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5113  TonB-dependent receptor plug  24.17 
 
 		 1102 aa  217  8e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298267  normal  0.131345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4416  TonB-dependent receptor plug  26.9 
 
 		 996 aa  215  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000494503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  23.27 
 
 		 1146 aa  215  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3164  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 1093 aa  215  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  25.54 
 
 		 1052 aa  214  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  26.6 
 
 		 1023 aa  214  9e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1601  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 1055 aa  214  9e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.709185 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2226  TonB-dependent receptor plug  24.83 
 
 		 1117 aa  214  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.377553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1574  TonB-dependent receptor plug  25.04 
 
 		 1155 aa  213  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923861  normal  0.0467053 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  25.07 
 
 		 1004 aa  212  3e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 1033 aa  211  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3556  TonB-dependent receptor, plug  25.83 
 
 		 1011 aa  211  6e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.70913  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  24.53 
 
 		 1147 aa  211  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  25.02 
 
 		 1192 aa  210  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 1008 aa  209  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 1080 aa  209  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 1071 aa  209  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  25.06 
 
 		 1023 aa  208  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4106  TonB-dependent receptor plug  24.5 
 
 		 1048 aa  207  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>