158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1885 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1885  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 481 aa  996    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2922  putative transcriptional regulator  53.33 
 
 		 477 aa  524  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  44.58 
 
 		 484 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  38.79 
 
 		 463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  38.01 
 
 		 412 aa  269  8.999999999999999e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4927  ATP-dependent DNA helicase recG  50.76 
 
 		 198 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  31.71 
 
 		 467 aa  176  7e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1467  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 508 aa  171  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  30.14 
 
 		 469 aa  150  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  27.16 
 
 		 480 aa  145  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0182  putative transcriptional regulator  29.36 
 
 		 478 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  26.01 
 
 		 480 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  27.65 
 
 		 494 aa  139  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  27.41 
 
 		 455 aa  136  9e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  25.37 
 
 		 471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  28.98 
 
 		 448 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  28.33 
 
 		 502 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  29.97 
 
 		 485 aa  125  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  28.16 
 
 		 467 aa  124  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  25.82 
 
 		 455 aa  124  4e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  30.56 
 
 		 456 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  26.4 
 
 		 433 aa  120  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1129  putative transcriptional regulator  28.42 
 
 		 475 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  26.79 
 
 		 448 aa  118  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  26.16 
 
 		 522 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  26.17 
 
 		 526 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  26.25 
 
 		 403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  26.25 
 
 		 403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  25.43 
 
 		 430 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0230  putative transcriptional regulator  29.57 
 
 		 456 aa  108  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  25.7 
 
 		 479 aa  107  5e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  25.67 
 
 		 620 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  25.65 
 
 		 469 aa  104  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2367  putative transcriptional regulator  27.17 
 
 		 509 aa  103  7e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2298  putative transcriptional regulator  25.86 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  0.0348046 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4113  putative transcriptional regulator  25.94 
 
 		 457 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0274471  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  27.06 
 
 		 386 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3241  filamentation induced by cAMP protein Fic  47.37 
 
 		 175 aa  100  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0416  filamentation induced by cAMP protein Fic  60.76 
 
 		 336 aa  97.8  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 385 aa  96.7  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  25.86 
 
 		 382 aa  94  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  25.42 
 
 		 446 aa  94  6e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  25.81 
 
 		 423 aa  92.4  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3863  filamentation induced by cAMP protein Fic  56.96 
 
 		 334 aa  92.8  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0343511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2125  putative transcriptional regulator  27.68 
 
 		 468 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0027  hypothetical protein  24.93 
 
 		 462 aa  90.5  6e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1900  putative transcriptional regulator  29.91 
 
 		 235 aa  89.7  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  27.11 
 
 		 454 aa  89  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  25.15 
 
 		 433 aa  88.2  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1812  hypothetical protein  40.88 
 
 		 224 aa  87.8  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  26.27 
 
 		 582 aa  87.8  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1744  putative transcriptional regulator  25.5 
 
 		 479 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.853827 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0911  putative transcriptional regulator  29.32 
 
 		 500 aa  85.9  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0980793  normal  0.225317 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0182  putative transcriptional regulator  27.5 
 
 		 606 aa  85.5  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3533  putative transcriptional regulator  27.65 
 
 		 459 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412037  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  27.19 
 
 		 462 aa  84.7  0.000000000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  24.41 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  25.07 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  24.87 
 
 		 663 aa  83.6  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4300  putative transcriptional regulator  23.61 
 
 		 581 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0062  transcriptional regulator  25.56 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1124  putative transcriptional regulator  24.59 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0803349  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  24.04 
 
 		 561 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1512  hypothetical protein  30.54 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398828 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1786  putative transcriptional regulator  23.82 
 
 		 519 aa  81.3  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.323375  hitchhiker  0.00000234079 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0664  putative transcriptional regulator  25.45 
 
 		 299 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1221  putative transcriptional regulator  25.34 
 
 		 394 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  26.82 
 
 		 456 aa  79.7  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4979  putative transcriptional regulator  27.32 
 
 		 586 aa  79.3  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011144 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0592  putative transcriptional regulator  45.05 
 
 		 582 aa  78.6  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.142374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2628  putative transcriptional regulator  24.53 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0334765 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1455  putative transcriptional regulator  26.24 
 
 		 462 aa  77.4  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.551479  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1459  putative transcriptional regulator  25.49 
 
 		 571 aa  77  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0385  putative transcriptional regulator  27.37 
 
 		 538 aa  77  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  24.83 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  24.94 
 
 		 545 aa  76.6  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  24.37 
 
 		 483 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  23.31 
 
 		 475 aa  75.1  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  23.5 
 
 		 548 aa  74.3  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  25.19 
 
 		 634 aa  74.3  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3604  putative transcriptional regulator  24.66 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0147385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  24.7 
 
 		 402 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  25.45 
 
 		 412 aa  73.2  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1538  MloB  22.4 
 
 		 483 aa  72  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.00000000000404574  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2494  hypothetical protein  40.21 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0100  transcriptional regulator  27.49 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0893  putative transcriptional regulator  39.39 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.472007  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0250  putative transcriptional regulator  24.84 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0152  putative transcriptional regulator  23.06 
 
 		 483 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  23.53 
 
 		 499 aa  70.9  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0888  hypothetical protein  34.07 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000709992  hitchhiker  0.0000000000930173 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2669  Fic family protein  51.56 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0638  putative transcriptional regulator  25.65 
 
 		 488 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 687 aa  70.1  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  26.03 
 
 		 572 aa  69.7  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0054  putative transcriptional regulator  35.58 
 
 		 226 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00302392  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0182  putative transcriptional regulator  25.99 
 
 		 473 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5813  putative transcriptional regulator  23.91 
 
 		 564 aa  68.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00457165 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  35.48 
 
 		 551 aa  68.9  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0615  putative transcriptional regulator  32.8 
 
 		 472 aa  68.2  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>