More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0185 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  100 
 
 
851 aa  1718    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  98.12 
 
 
853 aa  1688    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  32.8 
 
 
715 aa  303  9e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 
720 aa  294  4e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  30 
 
 
687 aa  270  8e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 
713 aa  255  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  30.1 
 
 
695 aa  254  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 
712 aa  248  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 
690 aa  245  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 
690 aa  244  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 
729 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 
697 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 
748 aa  234  5e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 
713 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1802  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 
743 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 
700 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 
757 aa  233  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 
743 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 
736 aa  231  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 
732 aa  230  9e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 
763 aa  229  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 
702 aa  228  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 
666 aa  228  5.0000000000000005e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2484  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 
744 aa  227  6e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000223864  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 
744 aa  227  9e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000583553  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 
761 aa  226  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2715  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 
733 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 
695 aa  223  9.999999999999999e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 
794 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 
763 aa  219  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2321  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 
744 aa  218  5e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.130994  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 
747 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1660  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 
729 aa  214  7e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000750921  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 
733 aa  211  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 
765 aa  209  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 
767 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 
730 aa  208  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.87 
 
 
739 aa  204  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 
730 aa  202  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 
710 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 
764 aa  197  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 
775 aa  197  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 
730 aa  197  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 
783 aa  196  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1458  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 
694 aa  196  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.552636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 
762 aa  196  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 
803 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  26.59 
 
 
864 aa  194  7e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 
788 aa  194  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 
713 aa  193  9e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 
802 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 
803 aa  193  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 
704 aa  192  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 
753 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 
753 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.44 
 
 
759 aa  191  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 
724 aa  191  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 
720 aa  190  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 
773 aa  189  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 
761 aa  189  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 
741 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 
712 aa  188  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 
733 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 
737 aa  188  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 
771 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 
732 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26 
 
 
729 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 
670 aa  186  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 
732 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 
764 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 
773 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 
771 aa  185  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  28.05 
 
 
784 aa  185  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 
736 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  30.85 
 
 
766 aa  181  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 
764 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 
728 aa  180  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 
743 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 
774 aa  180  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 
734 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 
762 aa  179  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 
743 aa  178  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 
809 aa  178  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  27.46 
 
 
822 aa  177  6e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 
817 aa  177  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  32.78 
 
 
859 aa  177  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 
777 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.73 
 
 
755 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 
680 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 
763 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 
710 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 
733 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 
758 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  27.22 
 
 
767 aa  174  6.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 
771 aa  174  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 
741 aa  173  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 
712 aa  173  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 
723 aa  173  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 
779 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 
787 aa  171  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>