More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2104 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2370  diguanylate cyclase  99.42 
 
 		 342 aa  700    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.257282  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2104  diguanylate cyclase  100 
 
 		 342 aa  704    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2092  diguanylate cyclase  99.42 
 
 		 342 aa  700    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0157551  normal  0.671157 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2253  diguanylate cyclase  99.42 
 
 		 342 aa  700    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0242555  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1872  diguanylate cyclase  85.67 
 
 		 342 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.97558 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2096  diguanylate cyclase  86.14 
 
 		 368 aa  610  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2227  diguanylate cyclase  85.09 
 
 		 342 aa  608  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2049  GGDEF family protein  84.95 
 
 		 319 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2102  diguanylate cyclase  86.69 
 
 		 308 aa  553  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307021  normal  0.599711 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1927  diguanylate cyclase  62.05 
 
 		 340 aa  429  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0449945  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2077  diguanylate cyclase  61.63 
 
 		 343 aa  423  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.984314  normal  0.163131 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1878  GGDEF domain-containing protein  60.48 
 
 		 339 aa  422  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2040  diguanylate cyclase  61.38 
 
 		 347 aa  423  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.405567  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2531  diguanylate cyclase  59.16 
 
 		 347 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.204125  normal  0.837026 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2325  diguanylate cyclase  57.19 
 
 		 350 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.74843  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1759  GGDEF domain-containing protein  51.65 
 
 		 355 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.538539  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1019  diguanylate cyclase  36.56 
 
 		 351 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2754  diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 355 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0798314  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2322  diguanylate cyclase  36.22 
 
 		 354 aa  207  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2834  diguanylate cyclase  35.29 
 
 		 355 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2462  GGDEF domain-containing protein  35.29 
 
 		 355 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.118701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3973  hypothetical protein  34.67 
 
 		 355 aa  198  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0517181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1658  diguanylate cyclase  35.51 
 
 		 354 aa  194  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.287196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2986  diguanylate cyclase  34.67 
 
 		 352 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0275567 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1323  diguanylate cyclase  32.92 
 
 		 350 aa  181  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134516  normal  0.420197 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4332  diguanylate cyclase  32.95 
 
 		 353 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.338226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1264  diguanylate cyclase  34.43 
 
 		 355 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1290  diguanylate cyclase  31.1 
 
 		 353 aa  179  9e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3254  diguanylate cyclase  32.74 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00411067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3324  diguanylate cyclase  32.52 
 
 		 353 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0172  GGDEF domain-containing protein  34.77 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06694  hypothetical protein  32.26 
 
 		 337 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000797  GGDEF family protein  32.26 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0200  diguanylate cyclase  31.86 
 
 		 352 aa  167  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.321217  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4463  diguanylate cyclase  33.86 
 
 		 372 aa  166  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.379038 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4352  diguanylate cyclase  33.54 
 
 		 369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3983  diguanylate cyclase  33.54 
 
 		 369 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.349216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2312  GGDEF domain-containing protein  32.38 
 
 		 341 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0283  GGDEF family protein  31.21 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.286485  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0457  diguanylate cyclase  42.46 
 
 		 349 aa  153  4e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1832  diguanylate cyclase  30.61 
 
 		 504 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.252767  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0998  diguanylate cyclase  32.49 
 
 		 352 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660105  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2197  GGDEF family protein  31.69 
 
 		 341 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0820  GGDEF domain-containing protein  33.65 
 
 		 333 aa  149  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2490  diguanylate cyclase  32.75 
 
 		 341 aa  149  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.316308  normal  0.521612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3261  diguanylate cyclase  28.39 
 
 		 360 aa  149  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.455053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1831  diguanylate cyclase  31.98 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0533362  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2446  diguanylate cyclase  31.98 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0209282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3286  diguanylate cyclase  28.49 
 
 		 352 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3062  diguanylate cyclase  28.49 
 
 		 352 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2395  diguanylate cyclase  32.82 
 
 		 359 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.423308  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3704  diguanylate cyclase  44.21 
 
 		 460 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1879  diguanylate cyclase  31.69 
 
 		 341 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2126  diguanylate cyclase  32.37 
 
 		 341 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.128443  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1741  diguanylate cyclase  30.41 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0680  diguanylate cyclase  43.68 
 
 		 466 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1845  diguanylate cyclase  31.4 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103325  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2198  diguanylate cyclase  32.27 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.83837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2275  diguanylate cyclase  32.27 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2514  diguanylate cyclase  29.51 
 
 		 341 aa  143  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.39605  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2408  diguanylate cyclase  31.58 
 
 		 341 aa  143  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2019  diguanylate cyclase  29.38 
 
 		 355 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0465  diguanylate cyclase  30 
 
 		 340 aa  142  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.254562  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1348  response regulator PleD  46.33 
 
 		 457 aa  142  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2241  diguanylate cyclase  30.63 
 
 		 355 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2827  diguanylate cyclase  34.07 
 
 		 348 aa  142  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2748  diguanylate cyclase  29.9 
 
 		 352 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.246546  normal  0.0545261 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2626  diguanylate cyclase  32.27 
 
 		 599 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1282  diguanylate cyclase  40.7 
 
 		 578 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3165  diguanylate cyclase  40.61 
 
 		 579 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.624427  hitchhiker  0.00241131 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2596  diguanylate cyclase  30.03 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3022  diguanylate cyclase  40.61 
 
 		 579 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.238574  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1211  diguanylate cyclase  40.7 
 
 		 578 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0050  putative diguanylate cyclase  39.15 
 
 		 696 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315879  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1212  diguanylate cyclase  40.2 
 
 		 578 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3381  diguanylate cyclase  48.48 
 
 		 622 aa  139  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3007  diguanylate cyclase  40.61 
 
 		 579 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3306  diguanylate cyclase  43.35 
 
 		 324 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198506  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2671  diguanylate cyclase  37.98 
 
 		 578 aa  138  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00272144  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0638  diguanylate cyclase  38.91 
 
 		 569 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0223  diguanylate cyclase  42.22 
 
 		 357 aa  138  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.133267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0509  diguanylate cyclase  44.16 
 
 		 498 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480754 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1298  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.42 
 
 		 353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000090214  hitchhiker  0.00354722 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3023  diguanylate cyclase  44.44 
 
 		 362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1479  diguanylate cyclase  29.11 
 
 		 341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1356  diguanylate cyclase  40.1 
 
 		 584 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.786537  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0570  diguanylate cyclase  42.77 
 
 		 324 aa  137  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0452  diguanylate cyclase  42.2 
 
 		 323 aa  137  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0571  diguanylate cyclase  42.77 
 
 		 324 aa  137  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3459  diguanylate cyclase  42.77 
 
 		 324 aa  136  5e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0094  diguanylate cyclase  34.26 
 
 		 451 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2939  GGDEF  44.04 
 
 		 318 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.417006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1870  GGDEF domain-containing protein  43.03 
 
 		 342 aa  135  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4407  GGDEF family protein  41.75 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0304  diguanylate cyclase  32.33 
 
 		 464 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1795  diguanylate cyclase  30.52 
 
 		 339 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2001  GGDEF family protein  30.27 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0435343  normal  0.378089 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1643  GGDEF/response regulator receiver domain-containing protein  42.62 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1355  diguanylate cyclase  43.01 
 
 		 487 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133394  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2202  diguanylate cyclase  29.88 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.758849  normal  0.575152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>