More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2827 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2827  diguanylate cyclase  100 
 
 		 348 aa  689    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3261  diguanylate cyclase  44.62 
 
 		 360 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.455053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3286  diguanylate cyclase  42.99 
 
 		 352 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3062  diguanylate cyclase  42.68 
 
 		 352 aa  239  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2395  diguanylate cyclase  42.07 
 
 		 359 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.423308  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1658  diguanylate cyclase  39.52 
 
 		 354 aa  187  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.287196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2748  diguanylate cyclase  35.6 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.246546  normal  0.0545261 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0998  diguanylate cyclase  36.5 
 
 		 352 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1323  diguanylate cyclase  38.46 
 
 		 350 aa  177  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134516  normal  0.420197 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3254  diguanylate cyclase  34.21 
 
 		 351 aa  176  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00411067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3973  hypothetical protein  40.39 
 
 		 355 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0517181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2322  diguanylate cyclase  43.16 
 
 		 354 aa  175  9e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2754  diguanylate cyclase  35.74 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0798314  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2462  GGDEF domain-containing protein  35.11 
 
 		 355 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.118701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2834  diguanylate cyclase  37.32 
 
 		 355 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1290  diguanylate cyclase  40.45 
 
 		 353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2986  diguanylate cyclase  36.43 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0275567 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2531  diguanylate cyclase  34.96 
 
 		 347 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.204125  normal  0.837026 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1759  GGDEF domain-containing protein  40.59 
 
 		 355 aa  162  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.538539  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4352  diguanylate cyclase  33.05 
 
 		 369 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4463  diguanylate cyclase  34.9 
 
 		 372 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.379038 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4332  diguanylate cyclase  40.77 
 
 		 353 aa  159  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.338226 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3324  diguanylate cyclase  34.85 
 
 		 353 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3983  diguanylate cyclase  32.19 
 
 		 369 aa  155  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.349216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2596  diguanylate cyclase  33.73 
 
 		 343 aa  153  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0404  diguanylate cyclase  37.77 
 
 		 378 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.012365 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2092  diguanylate cyclase  34.07 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0157551  normal  0.671157 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2370  diguanylate cyclase  34.07 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.257282  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2077  diguanylate cyclase  34.57 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.984314  normal  0.163131 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2253  diguanylate cyclase  34.07 
 
 		 342 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0242555  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1019  diguanylate cyclase  36.8 
 
 		 351 aa  142  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1832  diguanylate cyclase  36.08 
 
 		 504 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.252767  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2481  diguanylate cyclase  37.23 
 
 		 374 aa  142  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2104  diguanylate cyclase  34.07 
 
 		 342 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0172  GGDEF domain-containing protein  36.9 
 
 		 328 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2227  diguanylate cyclase  33.58 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2312  GGDEF domain-containing protein  30.26 
 
 		 341 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0050  putative diguanylate cyclase  37.98 
 
 		 696 aa  139  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315879  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2325  diguanylate cyclase  32.11 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.74843  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2049  GGDEF family protein  32.6 
 
 		 319 aa  138  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1872  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 342 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.97558 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2040  diguanylate cyclase  32.44 
 
 		 347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.405567  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000797  GGDEF family protein  28.61 
 
 		 337 aa  136  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1695  diguanylate cyclase  43.1 
 
 		 753 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1878  GGDEF domain-containing protein  34.65 
 
 		 339 aa  136  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2490  diguanylate cyclase  30.5 
 
 		 341 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.316308  normal  0.521612 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2126  diguanylate cyclase  30.41 
 
 		 341 aa  135  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.128443  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1927  diguanylate cyclase  33.62 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0449945  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2408  diguanylate cyclase  31.59 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0144  diguanylate cyclase  38.05 
 
 		 642 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5099  diguanylate cyclase  38.76 
 
 		 653 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.873917  normal  0.160564 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2001  GGDEF family protein  32.01 
 
 		 347 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0435343  normal  0.378089 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0610  two component response regulator  42.11 
 
 		 649 aa  132  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2096  diguanylate cyclase  34.91 
 
 		 368 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2197  GGDEF family protein  30.43 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0200  diguanylate cyclase  28.06 
 
 		 352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.321217  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1741  diguanylate cyclase  29.57 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2075  GGDEF protein  30.72 
 
 		 334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.605759  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2198  diguanylate cyclase  30.72 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.83837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2275  diguanylate cyclase  30.72 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06694  hypothetical protein  27.44 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1387  cyclic nucleotide-binding protein  42.29 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2446  diguanylate cyclase  29.7 
 
 		 341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0209282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1916  diguanylate cyclase  41.32 
 
 		 736 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1879  diguanylate cyclase  29.39 
 
 		 341 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5250  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.58 
 
 		 360 aa  129  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.395511  normal  0.949965 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0803  diguanylate cyclase  37.37 
 
 		 346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0162  diguanylate cyclase  37.9 
 
 		 614 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1795  diguanylate cyclase  29.94 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0146  diguanylate cyclase  37.8 
 
 		 645 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1831  diguanylate cyclase  29.39 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0533362  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2179  diguanylate cyclase  40.22 
 
 		 477 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000210421  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2241  diguanylate cyclase  29.63 
 
 		 355 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2019  diguanylate cyclase  30.28 
 
 		 355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4798  diguanylate cyclase  39.11 
 
 		 485 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393558 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0129  GGDEF domain-containing protein  37.32 
 
 		 645 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3998  diguanylate cyclase  40.48 
 
 		 591 aa  126  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4124  diguanylate cyclase  40.78 
 
 		 485 aa  126  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0457  diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 349 aa  125  9e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2514  diguanylate cyclase  28.62 
 
 		 341 aa  125  9e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.39605  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2165  diguanylate cyclase  39.3 
 
 		 460 aa  125  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0820  GGDEF domain-containing protein  26.95 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1662  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.7 
 
 		 820 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.29973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3846  diguanylate cyclase  42.94 
 
 		 405 aa  125  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29300  Response regulator  44.69 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1341  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.76 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1789  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.64 
 
 		 794 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.993763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0507  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.83 
 
 		 557 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02019  Putative signal protein with GGDEF domain  42.94 
 
 		 494 aa  124  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3032  diguanylate cyclase  39.56 
 
 		 547 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2157  diguanylate cyclase  39.36 
 
 		 460 aa  123  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0941263  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3540  diguanylate cyclase  42.16 
 
 		 365 aa  123  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.123648 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2167  diguanylate cyclase  39.36 
 
 		 460 aa  123  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0116704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1679  diguanylate cyclase  39.36 
 
 		 460 aa  123  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1575  diguanylate cyclase  39.36 
 
 		 460 aa  123  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1845  diguanylate cyclase  29.09 
 
 		 341 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103325  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1683  diguanylate cyclase  39.36 
 
 		 460 aa  123  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1516  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.81 
 
 		 352 aa  123  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0065858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2103  diguanylate cyclase  39.36 
 
 		 460 aa  123  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0266  GGDEF  37.85 
 
 		 690 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>