More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0820 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0820  GGDEF domain-containing protein  100 
 
 		 333 aa  686    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1019  diguanylate cyclase  31.85 
 
 		 351 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3973  hypothetical protein  30.06 
 
 		 355 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0517181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1323  diguanylate cyclase  33.74 
 
 		 350 aa  166  5.9999999999999996e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134516  normal  0.420197 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3983  diguanylate cyclase  29.82 
 
 		 369 aa  163  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.349216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0465  diguanylate cyclase  31.86 
 
 		 340 aa  164  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.254562  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2834  diguanylate cyclase  29.79 
 
 		 355 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2322  diguanylate cyclase  30.09 
 
 		 354 aa  161  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4352  diguanylate cyclase  29.82 
 
 		 369 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4463  diguanylate cyclase  29.82 
 
 		 372 aa  159  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.379038 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2531  diguanylate cyclase  33.12 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.204125  normal  0.837026 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1759  GGDEF domain-containing protein  32.18 
 
 		 355 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.538539  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2462  GGDEF domain-containing protein  31.87 
 
 		 355 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.118701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3254  diguanylate cyclase  31.42 
 
 		 351 aa  156  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00411067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1658  diguanylate cyclase  29.23 
 
 		 354 aa  156  6e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.287196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2126  diguanylate cyclase  32.91 
 
 		 341 aa  155  9e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.128443  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0283  GGDEF family protein  31.68 
 
 		 339 aa  153  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.286485  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2754  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 355 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0798314  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2325  diguanylate cyclase  31.33 
 
 		 350 aa  151  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.74843  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2446  diguanylate cyclase  33.12 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0209282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1845  diguanylate cyclase  32.49 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103325  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2092  diguanylate cyclase  33.65 
 
 		 342 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0157551  normal  0.671157 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2370  diguanylate cyclase  33.65 
 
 		 342 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.257282  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2253  diguanylate cyclase  33.01 
 
 		 342 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0242555  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2104  diguanylate cyclase  33.65 
 
 		 342 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2077  diguanylate cyclase  33.12 
 
 		 343 aa  149  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.984314  normal  0.163131 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1879  diguanylate cyclase  32.81 
 
 		 341 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0200  diguanylate cyclase  28.62 
 
 		 352 aa  149  7e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.321217  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1927  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 340 aa  149  9e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0449945  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0998  diguanylate cyclase  29.57 
 
 		 352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1831  diguanylate cyclase  32.81 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0533362  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1872  diguanylate cyclase  32.27 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.97558 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2049  GGDEF family protein  31.95 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2096  diguanylate cyclase  32.05 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1741  diguanylate cyclase  32.18 
 
 		 341 aa  146  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2986  diguanylate cyclase  30.23 
 
 		 352 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0275567 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2227  diguanylate cyclase  32.05 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2075  GGDEF protein  30.12 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.605759  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2408  diguanylate cyclase  30.38 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2490  diguanylate cyclase  31.03 
 
 		 341 aa  143  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.316308  normal  0.521612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0172  GGDEF domain-containing protein  28.44 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06694  hypothetical protein  29.77 
 
 		 337 aa  142  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2198  diguanylate cyclase  30.06 
 
 		 341 aa  142  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.83837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2275  diguanylate cyclase  30.06 
 
 		 341 aa  142  7e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0304  diguanylate cyclase  30.34 
 
 		 464 aa  141  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2197  GGDEF family protein  29.75 
 
 		 341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3324  diguanylate cyclase  26.75 
 
 		 353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2312  GGDEF domain-containing protein  28.75 
 
 		 341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4332  diguanylate cyclase  26.52 
 
 		 353 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.338226 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2514  diguanylate cyclase  30.35 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.39605  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2241  diguanylate cyclase  31.87 
 
 		 355 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1264  diguanylate cyclase  30.72 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000797  GGDEF family protein  30.57 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2748  diguanylate cyclase  28.83 
 
 		 352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.246546  normal  0.0545261 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2001  GGDEF family protein  30.09 
 
 		 347 aa  136  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0435343  normal  0.378089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3261  diguanylate cyclase  26.42 
 
 		 360 aa  135  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.455053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2019  diguanylate cyclase  31.13 
 
 		 355 aa  135  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1878  GGDEF domain-containing protein  30.89 
 
 		 339 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2596  diguanylate cyclase  29.38 
 
 		 343 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3286  diguanylate cyclase  26.93 
 
 		 352 aa  132  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1795  diguanylate cyclase  27.58 
 
 		 339 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3062  diguanylate cyclase  26.63 
 
 		 352 aa  132  9e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1290  diguanylate cyclase  27.3 
 
 		 353 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0094  diguanylate cyclase  37.82 
 
 		 451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2040  diguanylate cyclase  29.39 
 
 		 347 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.405567  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1479  diguanylate cyclase  29.06 
 
 		 341 aa  129  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1497  response regulator PleD  37.75 
 
 		 454 aa  129  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7005  GGDEF family protein  37.84 
 
 		 568 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.97 
 
 		 367 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1501  diguanylate cyclase  39.04 
 
 		 360 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.15986  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0078  GGDEF domain-containing protein  36.55 
 
 		 565 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.12 
 
 		 454 aa  127  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2395  diguanylate cyclase  29.38 
 
 		 359 aa  126  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.423308  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3711  diguanylate cyclase  40.76 
 
 		 320 aa  126  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336724  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1387  cyclic nucleotide-binding protein  40.22 
 
 		 320 aa  126  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03006  hypothetical protein  35.98 
 
 		 520 aa  125  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2365  diguanylate cyclase  40.48 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0108211  normal  0.148457 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01318  predicted diguanylate cyclase, GGDEF domain signalling protein  40.99 
 
 		 410 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.536328  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2303  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.99 
 
 		 410 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136359  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3631  GGDEF domain-containing protein  37.44 
 
 		 722 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770761  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01328  hypothetical protein  40.99 
 
 		 410 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.465042  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2827  diguanylate cyclase  26.95 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4207  GGDEF domain-containing protein  39.68 
 
 		 625 aa  123  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1555  sensory box-containing diguanylate cyclase  40.99 
 
 		 430 aa  124  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3733  diguanylate cyclase  39.79 
 
 		 625 aa  124  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1458  sensory box-containing diguanylate cyclase  40.99 
 
 		 430 aa  124  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1781  sensory box-containing diguanylate cyclase  40.99 
 
 		 430 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1989  sensory box-containing diguanylate cyclase  40.99 
 
 		 430 aa  124  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.641954 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1366  diguanylate cyclase  40.49 
 
 		 369 aa  123  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2801  diguanylate cyclase  39.01 
 
 		 628 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.615763  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0397  diguanylate cyclase  39.79 
 
 		 625 aa  123  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3559  diguanylate cyclase  39.79 
 
 		 625 aa  123  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0050  putative diguanylate cyclase  35.87 
 
 		 696 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315879  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2748  diguanylate cyclase  41.86 
 
 		 651 aa  122  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0199433  hitchhiker  0.0067097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3248  diguanylate cyclase  37.63 
 
 		 420 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2284  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.37 
 
 		 410 aa  122  8e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.629539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3614  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.49 
 
 		 310 aa  122  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2422  diguanylate cyclase  40.72 
 
 		 532 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0498  diguanylate cyclase  39.15 
 
 		 624 aa  122  9e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3476  diguanylate cyclase  40.24 
 
 		 298 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>