More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000797 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000797  GGDEF family protein  100 
 
 		 337 aa  699    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06694  hypothetical protein  89.61 
 
 		 337 aa  632  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0283  GGDEF family protein  68.15 
 
 		 339 aa  496  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.286485  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2197  GGDEF family protein  50.89 
 
 		 341 aa  361  8e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2198  diguanylate cyclase  49.7 
 
 		 341 aa  361  1e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.83837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2490  diguanylate cyclase  48.97 
 
 		 341 aa  359  3e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.316308  normal  0.521612 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2275  diguanylate cyclase  49.4 
 
 		 341 aa  360  3e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1741  diguanylate cyclase  49.56 
 
 		 341 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2408  diguanylate cyclase  49.4 
 
 		 341 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1831  diguanylate cyclase  49.26 
 
 		 341 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0533362  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1879  diguanylate cyclase  48.8 
 
 		 341 aa  354  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2446  diguanylate cyclase  49.1 
 
 		 341 aa  354  1e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0209282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1845  diguanylate cyclase  48.8 
 
 		 341 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103325  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2514  diguanylate cyclase  48.5 
 
 		 341 aa  352  4e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.39605  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2126  diguanylate cyclase  48.67 
 
 		 341 aa  351  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.128443  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1795  diguanylate cyclase  47.62 
 
 		 339 aa  348  9e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1479  diguanylate cyclase  50.3 
 
 		 341 aa  345  4e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2312  GGDEF domain-containing protein  47.92 
 
 		 341 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2001  GGDEF family protein  48.21 
 
 		 347 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0435343  normal  0.378089 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0465  diguanylate cyclase  47.01 
 
 		 340 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.254562  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1264  diguanylate cyclase  35.78 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1019  diguanylate cyclase  34.23 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2754  diguanylate cyclase  33.86 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0798314  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2462  GGDEF domain-containing protein  33.86 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.118701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3973  hypothetical protein  33.86 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0517181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2986  diguanylate cyclase  32.06 
 
 		 352 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0275567 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2834  diguanylate cyclase  32.25 
 
 		 355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2322  diguanylate cyclase  31.95 
 
 		 354 aa  182  6e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1878  GGDEF domain-containing protein  31.66 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2370  diguanylate cyclase  32.26 
 
 		 342 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.257282  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1658  diguanylate cyclase  31.55 
 
 		 354 aa  171  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.287196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2104  diguanylate cyclase  32.26 
 
 		 342 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2092  diguanylate cyclase  32.26 
 
 		 342 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0157551  normal  0.671157 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2227  diguanylate cyclase  31.76 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2253  diguanylate cyclase  32.26 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0242555  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1872  diguanylate cyclase  31.66 
 
 		 342 aa  169  8e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.97558 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2096  diguanylate cyclase  32.15 
 
 		 368 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2077  diguanylate cyclase  31.82 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.984314  normal  0.163131 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2325  diguanylate cyclase  31.61 
 
 		 350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.74843  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1759  GGDEF domain-containing protein  30.95 
 
 		 355 aa  166  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.538539  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3324  diguanylate cyclase  30.45 
 
 		 353 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1927  diguanylate cyclase  28.61 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0449945  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1323  diguanylate cyclase  29.39 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134516  normal  0.420197 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2049  GGDEF family protein  30.82 
 
 		 319 aa  161  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0200  diguanylate cyclase  30.51 
 
 		 352 aa  159  9e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.321217  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0998  diguanylate cyclase  29.64 
 
 		 352 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2531  diguanylate cyclase  31.12 
 
 		 347 aa  156  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.204125  normal  0.837026 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0172  GGDEF domain-containing protein  26.93 
 
 		 328 aa  155  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3261  diguanylate cyclase  32 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.455053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3286  diguanylate cyclase  30.06 
 
 		 352 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1290  diguanylate cyclase  28.66 
 
 		 353 aa  153  5e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3062  diguanylate cyclase  29.75 
 
 		 352 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2040  diguanylate cyclase  29.27 
 
 		 347 aa  151  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.405567  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3254  diguanylate cyclase  28.05 
 
 		 351 aa  150  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00411067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2748  diguanylate cyclase  29.91 
 
 		 352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.246546  normal  0.0545261 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4332  diguanylate cyclase  29.85 
 
 		 353 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.338226 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.19 
 
 		 634 aa  144  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4463  diguanylate cyclase  28.92 
 
 		 372 aa  143  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.379038 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2102  diguanylate cyclase  30.32 
 
 		 308 aa  143  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307021  normal  0.599711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4352  diguanylate cyclase  28.96 
 
 		 369 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0820  GGDEF domain-containing protein  30.57 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2202  diguanylate cyclase  26.71 
 
 		 342 aa  137  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.758849  normal  0.575152 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2827  diguanylate cyclase  28.61 
 
 		 348 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1832  diguanylate cyclase  26.71 
 
 		 504 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.252767  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3983  diguanylate cyclase  28.66 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.349216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4748  diguanylate cyclase  43.85 
 
 		 377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1346  sensory box/GGDEF domain protein  44.3 
 
 		 425 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0021  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.05 
 
 		 668 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0755  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.84 
 
 		 298 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1157  PAS:GGDEF  42.41 
 
 		 418 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0019  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.05 
 
 		 668 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1366  diguanylate cyclase  41.95 
 
 		 369 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1163  diguanylate cyclase  39.89 
 
 		 308 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0304  diguanylate cyclase  29.18 
 
 		 464 aa  127  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2395  diguanylate cyclase  28.97 
 
 		 359 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.423308  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0050  putative diguanylate cyclase  36.71 
 
 		 696 aa  126  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315879  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1737  diguanylate cyclase  42.08 
 
 		 390 aa  126  6e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0222793  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3508  diguanylate cyclase  38.21 
 
 		 638 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0970585 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2050  diguanylate cyclase  40 
 
 		 523 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0129  GGDEF domain-containing protein  32.16 
 
 		 645 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4128  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  41.92 
 
 		 663 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02019  Putative signal protein with GGDEF domain  39.11 
 
 		 494 aa  124  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2063  diguanylate cyclase  40.21 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.553076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1355  diguanylate cyclase  40.48 
 
 		 487 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.133394  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0457  diguanylate cyclase  37.04 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0162  diguanylate cyclase  32.62 
 
 		 614 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5099  diguanylate cyclase  33.21 
 
 		 653 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.873917  normal  0.160564 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.96 
 
 		 550 aa  123  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1293  diguanylate cyclase  40.57 
 
 		 432 aa  122  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.32079e-19 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1348  response regulator PleD  41.48 
 
 		 457 aa  122  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2979  diguanylate cyclase  41.57 
 
 		 490 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  32.91 
 
 		 343 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2596  diguanylate cyclase  23.99 
 
 		 343 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0747  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 508 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1315  diguanylate cyclase  43.18 
 
 		 608 aa  121  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243862  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0146  diguanylate cyclase  31.8 
 
 		 645 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  39.77 
 
 		 457 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.51 
 
 		 772 aa  121  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3673  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  33.8 
 
 		 1262 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2544  diguanylate cyclase  36.71 
 
 		 398 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.871243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>