More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2202 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2202  diguanylate cyclase  100 
 
 		 342 aa  691    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.758849  normal  0.575152 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1264  diguanylate cyclase  29.79 
 
 		 355 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0200  diguanylate cyclase  29.34 
 
 		 352 aa  150  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.321217  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1019  diguanylate cyclase  26.81 
 
 		 351 aa  147  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2531  diguanylate cyclase  29.74 
 
 		 347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.204125  normal  0.837026 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2275  diguanylate cyclase  27.69 
 
 		 341 aa  139  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1759  GGDEF domain-containing protein  27.7 
 
 		 355 aa  139  7e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.538539  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1323  diguanylate cyclase  28.27 
 
 		 350 aa  139  7e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134516  normal  0.420197 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2834  diguanylate cyclase  30 
 
 		 355 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2198  diguanylate cyclase  27.38 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.83837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2408  diguanylate cyclase  28 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2126  diguanylate cyclase  28.31 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.128443  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000797  GGDEF family protein  26.71 
 
 		 337 aa  137  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2370  diguanylate cyclase  29.88 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.257282  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2092  diguanylate cyclase  29.88 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0157551  normal  0.671157 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2040  diguanylate cyclase  28.88 
 
 		 347 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.405567  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2104  diguanylate cyclase  29.88 
 
 		 342 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2490  diguanylate cyclase  28.95 
 
 		 341 aa  133  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.316308  normal  0.521612 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2253  diguanylate cyclase  29.88 
 
 		 342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0242555  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2514  diguanylate cyclase  26.54 
 
 		 341 aa  132  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.39605  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1872  diguanylate cyclase  28.4 
 
 		 342 aa  132  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.97558 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0465  diguanylate cyclase  27.03 
 
 		 340 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.254562  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2197  GGDEF family protein  25.93 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1658  diguanylate cyclase  29.49 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.287196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2227  diguanylate cyclase  28.4 
 
 		 342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2322  diguanylate cyclase  28.25 
 
 		 354 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2325  diguanylate cyclase  27.41 
 
 		 350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.74843  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2001  GGDEF family protein  28.01 
 
 		 347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0435343  normal  0.378089 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1845  diguanylate cyclase  27.46 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103325  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2446  diguanylate cyclase  27.46 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0209282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06694  hypothetical protein  25.52 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1290  diguanylate cyclase  24.25 
 
 		 353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1741  diguanylate cyclase  26.91 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2986  diguanylate cyclase  29.55 
 
 		 352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0275567 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1879  diguanylate cyclase  27.16 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0283  GGDEF family protein  24.4 
 
 		 339 aa  126  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.286485  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1479  diguanylate cyclase  25.23 
 
 		 341 aa  125  7e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1795  diguanylate cyclase  26.2 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2096  diguanylate cyclase  27.35 
 
 		 368 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1831  diguanylate cyclase  27.16 
 
 		 341 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0533362  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2312  GGDEF domain-containing protein  25.3 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2754  diguanylate cyclase  29.17 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0798314  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1927  diguanylate cyclase  28.12 
 
 		 340 aa  123  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0449945  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3254  diguanylate cyclase  26.32 
 
 		 351 aa  122  7e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00411067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2462  GGDEF domain-containing protein  29.17 
 
 		 355 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.118701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1878  GGDEF domain-containing protein  31.27 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2049  GGDEF family protein  28.79 
 
 		 319 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2102  diguanylate cyclase  29.51 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307021  normal  0.599711 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2077  diguanylate cyclase  28.13 
 
 		 343 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.984314  normal  0.163131 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0404  diguanylate cyclase  27.73 
 
 		 378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.012365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3973  hypothetical protein  26.13 
 
 		 355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0517181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0172  GGDEF domain-containing protein  26.54 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3324  diguanylate cyclase  25.97 
 
 		 353 aa  105  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4463  diguanylate cyclase  26.81 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.379038 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0998  diguanylate cyclase  25.53 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2748  diguanylate cyclase  24.48 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.246546  normal  0.0545261 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0820  GGDEF domain-containing protein  26.5 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2075  GGDEF protein  27.55 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.605759  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4332  diguanylate cyclase  26.22 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.338226 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3261  diguanylate cyclase  24.2 
 
 		 360 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.455053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3983  diguanylate cyclase  26.98 
 
 		 369 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.349216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4352  diguanylate cyclase  26.04 
 
 		 369 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2596  diguanylate cyclase  23.99 
 
 		 343 aa  96.7  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3062  diguanylate cyclase  24.76 
 
 		 352 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3286  diguanylate cyclase  24.44 
 
 		 352 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0847  two component diguanylate cyclase  36.47 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2241  diguanylate cyclase  26.77 
 
 		 355 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0457  diguanylate cyclase  26.22 
 
 		 349 aa  90.9  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0034  diguanylate cyclase  28.21 
 
 		 433 aa  89.4  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523887  normal  0.941955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2827  diguanylate cyclase  25.16 
 
 		 348 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2395  diguanylate cyclase  24.1 
 
 		 359 aa  88.6  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.423308  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0094  diguanylate cyclase  28.8 
 
 		 451 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0129  GGDEF domain-containing protein  29.32 
 
 		 645 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1832  diguanylate cyclase  24.77 
 
 		 504 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.252767  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0803  diguanylate cyclase  29.67 
 
 		 346 aa  87  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4417  diguanylate cyclase  35.22 
 
 		 401 aa  87  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2019  diguanylate cyclase  25.39 
 
 		 355 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3316  diguanylate cyclase  34.62 
 
 		 307 aa  87  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2801  diguanylate cyclase  33.86 
 
 		 628 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.615763  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0085  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.62 
 
 		 301 aa  86.3  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3621  GGDEF  28.74 
 
 		 413 aa  86.3  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0388472 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3391  diguanylate cyclase  34.16 
 
 		 360 aa  85.9  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0652  diguanylate cyclase  33.54 
 
 		 280 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0146  diguanylate cyclase  28.27 
 
 		 645 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03046  GGDEF domain protein  28.65 
 
 		 518 aa  85.1  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2521  diguanylate cyclase  32.42 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12380  diguanylate cyclase  35.03 
 
 		 499 aa  84.3  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00534046  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6915  diguanylate cyclase  34.81 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2123  diguanylate cyclase  34.84 
 
 		 635 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0453  GGDEF domain-containing protein  29.95 
 
 		 641 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0144  diguanylate cyclase  28.57 
 
 		 642 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1158  diguanylate cyclase  28.98 
 
 		 507 aa  83.6  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1394  diguanylate cyclase  25.22 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0382042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0467  diguanylate cyclase  32.94 
 
 		 641 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0532  GGDEF domain-containing protein  31.68 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3132  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.67 
 
 		 493 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1078  diguanylate cyclase  28.41 
 
 		 507 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329883  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003591  GGDEF family protein  33.33 
 
 		 489 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0319  diguanylate cyclase  33.13 
 
 		 732 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2679  diguanylate cyclase  30.37 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>