More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2395 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2395  diguanylate cyclase  100 
 
 		 359 aa  730    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.423308  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3261  diguanylate cyclase  41.14 
 
 		 360 aa  250  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.455053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2827  diguanylate cyclase  42.07 
 
 		 348 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3062  diguanylate cyclase  39.05 
 
 		 352 aa  230  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3286  diguanylate cyclase  38.76 
 
 		 352 aa  228  8e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2754  diguanylate cyclase  38.24 
 
 		 355 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0798314  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3254  diguanylate cyclase  37.54 
 
 		 351 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00411067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2322  diguanylate cyclase  37.31 
 
 		 354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3973  hypothetical protein  38.01 
 
 		 355 aa  190  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0517181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2834  diguanylate cyclase  36.5 
 
 		 355 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1658  diguanylate cyclase  36.14 
 
 		 354 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.287196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2462  GGDEF domain-containing protein  36.53 
 
 		 355 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.118701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2986  diguanylate cyclase  36.98 
 
 		 352 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0275567 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0998  diguanylate cyclase  36.05 
 
 		 352 aa  178  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4332  diguanylate cyclase  33.82 
 
 		 353 aa  176  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.338226 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4463  diguanylate cyclase  33.14 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.379038 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4352  diguanylate cyclase  32.21 
 
 		 369 aa  173  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1323  diguanylate cyclase  32.52 
 
 		 350 aa  172  6.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.134516  normal  0.420197 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1019  diguanylate cyclase  35.29 
 
 		 351 aa  171  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3983  diguanylate cyclase  31.65 
 
 		 369 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.349216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3324  diguanylate cyclase  33.83 
 
 		 353 aa  169  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2077  diguanylate cyclase  34.97 
 
 		 343 aa  169  8e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.984314  normal  0.163131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0172  GGDEF domain-containing protein  33.23 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2748  diguanylate cyclase  37.32 
 
 		 352 aa  163  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.246546  normal  0.0545261 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2531  diguanylate cyclase  32.92 
 
 		 347 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.204125  normal  0.837026 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1878  GGDEF domain-containing protein  32.12 
 
 		 339 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1759  GGDEF domain-containing protein  31.91 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.538539  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2596  diguanylate cyclase  34.59 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1927  diguanylate cyclase  33.44 
 
 		 340 aa  157  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0449945  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2092  diguanylate cyclase  33.13 
 
 		 342 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0157551  normal  0.671157 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2370  diguanylate cyclase  33.13 
 
 		 342 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.257282  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2253  diguanylate cyclase  33.13 
 
 		 342 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0242555  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0200  diguanylate cyclase  31.37 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.321217  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2325  diguanylate cyclase  33.64 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.74843  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2104  diguanylate cyclase  32.82 
 
 		 342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2040  diguanylate cyclase  33.02 
 
 		 347 aa  151  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.405567  normal  0.0142229 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2227  diguanylate cyclase  32.61 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2049  GGDEF family protein  32.71 
 
 		 319 aa  150  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1872  diguanylate cyclase  32.3 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.97558 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0457  diguanylate cyclase  31.1 
 
 		 349 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2096  diguanylate cyclase  32.09 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2514  diguanylate cyclase  28.88 
 
 		 341 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.39605  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06694  hypothetical protein  30.28 
 
 		 337 aa  142  8e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2490  diguanylate cyclase  30.4 
 
 		 341 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.316308  normal  0.521612 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2312  GGDEF domain-containing protein  28.1 
 
 		 341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1264  diguanylate cyclase  31.18 
 
 		 355 aa  139  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0404  diguanylate cyclase  32.85 
 
 		 378 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.012365 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2126  diguanylate cyclase  28.65 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.128443  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000797  GGDEF family protein  29.28 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1290  diguanylate cyclase  34.31 
 
 		 353 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0283  GGDEF family protein  29.97 
 
 		 339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.286485  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1795  diguanylate cyclase  28.99 
 
 		 339 aa  133  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1479  diguanylate cyclase  26.81 
 
 		 341 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0820  GGDEF domain-containing protein  29.38 
 
 		 333 aa  132  7.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2446  diguanylate cyclase  28.27 
 
 		 341 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0209282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2408  diguanylate cyclase  30.46 
 
 		 341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2481  diguanylate cyclase  31.96 
 
 		 374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1741  diguanylate cyclase  28.27 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1831  diguanylate cyclase  28.27 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0533362  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1879  diguanylate cyclase  27.96 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2198  diguanylate cyclase  29.88 
 
 		 341 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.83837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2275  diguanylate cyclase  29.85 
 
 		 341 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1357  diguanylate cyclase  45.78 
 
 		 508 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.255633 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1845  diguanylate cyclase  28.27 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103325  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2197  GGDEF family protein  29.81 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1411  GGDEF domain-containing protein  43.5 
 
 		 493 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0895588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2102  diguanylate cyclase  30.34 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.307021  normal  0.599711 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2001  GGDEF family protein  29.54 
 
 		 347 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0435343  normal  0.378089 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2019  diguanylate cyclase  29.43 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2165  diguanylate cyclase  42.2 
 
 		 460 aa  123  5e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0349  diguanylate cyclase  43.23 
 
 		 523 aa  123  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.291431  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1832  diguanylate cyclase  28.9 
 
 		 504 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.252767  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4311  diguanylate cyclase  42.37 
 
 		 493 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.245548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2856  GGDEF domain-containing protein  35.54 
 
 		 568 aa  122  9e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.592717 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4400  diguanylate cyclase  41.81 
 
 		 493 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0034  diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523887  normal  0.941955 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1158  diguanylate cyclase  30.94 
 
 		 507 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2241  diguanylate cyclase  29.29 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1078  diguanylate cyclase  30.58 
 
 		 507 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329883  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2801  diguanylate cyclase  45.24 
 
 		 628 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.615763  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3677  response regulator PleD  40.68 
 
 		 461 aa  119  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00345303  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0094  diguanylate cyclase  39.88 
 
 		 451 aa  119  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3437  diguanylate cyclase  35.62 
 
 		 483 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0184931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2979  diguanylate cyclase  42.33 
 
 		 490 aa  119  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0787  GGDEF  31.38 
 
 		 585 aa  118  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109099  hitchhiker  0.00379197 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1341  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.86 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0854  diguanylate cyclase  36.65 
 
 		 507 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.485181  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4245  GGDEF domain-containing protein  39.76 
 
 		 477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1485  diguanylate cyclase  40.85 
 
 		 490 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3102  GGDEF domain-containing protein  37.44 
 
 		 580 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0842  diguanylate cyclase with extracellular sensor  36.82 
 
 		 484 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.105968  hitchhiker  0.00226884 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4293  GGDEF domain-containing protein  35.53 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0725016  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01741  Putative CHASE3/GGDEF domain-containing signal protein  43.75 
 
 		 563 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0039  diguanylate cyclase  34.11 
 
 		 521 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2931  diguanylate cyclase  35.37 
 
 		 432 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0819  diguanylate cyclase  36.2 
 
 		 507 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00531525  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1695  diguanylate cyclase  41.24 
 
 		 753 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6915  diguanylate cyclase  42.77 
 
 		 202 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0005  diguanylate cyclase  33.02 
 
 		 520 aa  117  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379493  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0471  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.85 
 
 		 572 aa  116  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.634401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>