More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1912 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2215  TonB-dependent receptor  55.62 
 
 		 971 aa  1040    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.169336  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1912  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 969 aa  1959    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1080  TonB-dependent receptor  36.54 
 
 		 937 aa  491  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72185  normal  0.584922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4100  TonB-dependent receptor  32.76 
 
 		 985 aa  402  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 860 aa  181  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  33.91 
 
 		 739 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 838 aa  166  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  34.57 
 
 		 795 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  39.85 
 
 		 896 aa  161  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  31.78 
 
 		 919 aa  156  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  34.8 
 
 		 903 aa  155  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  42.15 
 
 		 730 aa  155  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  39.26 
 
 		 747 aa  154  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  34.25 
 
 		 720 aa  152  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3422  TonB-dependent receptor, plug  38.81 
 
 		 345 aa  151  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209041  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  35.95 
 
 		 807 aa  150  9e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 730 aa  149  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  36.72 
 
 		 700 aa  150  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  33.41 
 
 		 710 aa  147  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  38.31 
 
 		 817 aa  147  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  35.65 
 
 		 789 aa  146  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  35.38 
 
 		 769 aa  144  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  37.66 
 
 		 775 aa  144  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  38.91 
 
 		 744 aa  144  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  35.89 
 
 		 822 aa  144  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 796 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 862 aa  142  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  36 
 
 		 765 aa  141  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  38.67 
 
 		 803 aa  141  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  32.57 
 
 		 783 aa  140  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 809 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  36.61 
 
 		 722 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  37.95 
 
 		 731 aa  138  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  33.6 
 
 		 757 aa  138  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  39.62 
 
 		 755 aa  137  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  34.3 
 
 		 796 aa  137  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  35.74 
 
 		 766 aa  137  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  32.97 
 
 		 784 aa  137  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1474  TonB-dependent receptor  38.05 
 
 		 817 aa  137  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.698611  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  34.84 
 
 		 737 aa  137  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  38.22 
 
 		 774 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  33.79 
 
 		 779 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  37.9 
 
 		 704 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  34.68 
 
 		 795 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  33.47 
 
 		 764 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  35.27 
 
 		 734 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  32.72 
 
 		 755 aa  136  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 832 aa  136  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  35.95 
 
 		 764 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  34.82 
 
 		 794 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  35.45 
 
 		 758 aa  135  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 767 aa  135  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  34.78 
 
 		 763 aa  135  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  34.58 
 
 		 723 aa  135  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  39.17 
 
 		 759 aa  135  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  37.22 
 
 		 767 aa  134  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  36.61 
 
 		 766 aa  134  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  33.04 
 
 		 785 aa  134  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  33.92 
 
 		 808 aa  134  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  34.17 
 
 		 859 aa  134  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 790 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 729 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  35.09 
 
 		 763 aa  133  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 731 aa  133  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 792 aa  132  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  33.18 
 
 		 803 aa  132  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 778 aa  132  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  33.49 
 
 		 790 aa  132  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02386  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 886 aa  132  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00704542  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 795 aa  132  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 771 aa  132  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  36.07 
 
 		 785 aa  132  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  37.13 
 
 		 780 aa  132  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  36.6 
 
 		 867 aa  131  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  34.09 
 
 		 767 aa  131  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  34.82 
 
 		 792 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4008  TonB-dependent receptor plug  35.68 
 
 		 365 aa  130  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  39.55 
 
 		 758 aa  130  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 756 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  34.36 
 
 		 783 aa  129  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 808 aa  129  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3437  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 812 aa  130  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0865  TonB-dependent receptor  35.2 
 
 		 829 aa  129  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0714067  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  33.59 
 
 		 800 aa  128  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  33.59 
 
 		 800 aa  128  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  36.72 
 
 		 753 aa  128  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  36.36 
 
 		 790 aa  127  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  31.8 
 
 		 778 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  35.91 
 
 		 717 aa  127  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  35 
 
 		 790 aa  127  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 732 aa  127  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 741 aa  127  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  35.14 
 
 		 783 aa  127  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  36.02 
 
 		 759 aa  127  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  35.86 
 
 		 786 aa  127  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  33.48 
 
 		 906 aa  127  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  36.49 
 
 		 743 aa  126  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  36.71 
 
 		 794 aa  126  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  31.69 
 
 		 776 aa  126  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0450  TonB-dependent receptor, plug  34.65 
 
 		 487 aa  126  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144048  normal  0.622728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>