157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4910 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  56.87 
 
 
803 aa  861    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  58.53 
 
 
801 aa  825    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  100 
 
 
801 aa  1614    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  74.8 
 
 
374 aa  196  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  64.23 
 
 
558 aa  171  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  56.64 
 
 
469 aa  169  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  59.52 
 
 
492 aa  165  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  61.72 
 
 
535 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  61.79 
 
 
472 aa  160  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  60.34 
 
 
489 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  61.16 
 
 
498 aa  157  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  58.91 
 
 
490 aa  157  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  58.14 
 
 
801 aa  157  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  60.33 
 
 
489 aa  155  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  57.38 
 
 
497 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  25.1 
 
 
1122 aa  150  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  54.29 
 
 
368 aa  149  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  55.91 
 
 
493 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  57.85 
 
 
451 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  58.47 
 
 
468 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  53.6 
 
 
548 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  53.38 
 
 
461 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  55.12 
 
 
603 aa  143  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  53.91 
 
 
500 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  53.91 
 
 
547 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  53.72 
 
 
380 aa  139  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  48.2 
 
 
589 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  47.73 
 
 
567 aa  125  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  46.92 
 
 
391 aa  114  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  45.74 
 
 
479 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  47.15 
 
 
568 aa  111  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  41.98 
 
 
709 aa  108  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  38.8 
 
 
634 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  43.75 
 
 
516 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  40.77 
 
 
492 aa  101  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  42.4 
 
 
494 aa  99.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  45.24 
 
 
373 aa  98.6  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  37.5 
 
 
890 aa  97.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  37.9 
 
 
426 aa  95.9  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  37.41 
 
 
414 aa  92.8  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.17 
 
 
933 aa  92  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  33.33 
 
 
642 aa  91.3  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  41.79 
 
 
627 aa  90.9  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  37.78 
 
 
597 aa  90.1  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  43.2 
 
 
574 aa  90.1  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  42.06 
 
 
384 aa  90.5  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.53 
 
 
531 aa  89.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.74 
 
 
1072 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  37.72 
 
 
1207 aa  87  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  38.84 
 
 
446 aa  86.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  40.62 
 
 
358 aa  86.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  35.43 
 
 
488 aa  85.9  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  39.02 
 
 
1128 aa  85.1  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  39.13 
 
 
452 aa  84  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  34.38 
 
 
522 aa  82.4  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  37.5 
 
 
417 aa  82.4  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  35.25 
 
 
496 aa  82.4  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  38.79 
 
 
732 aa  82.4  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  26.41 
 
 
726 aa  82.4  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  37.82 
 
 
423 aa  80.5  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  37.4 
 
 
465 aa  78.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  38.57 
 
 
165 aa  77.4  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  35.11 
 
 
1016 aa  75.5  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  36.11 
 
 
494 aa  75.5  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.65 
 
 
476 aa  72.4  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.71 
 
 
580 aa  72.4  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  35.71 
 
 
275 aa  72  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.07 
 
 
815 aa  71.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  32.14 
 
 
493 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  36.29 
 
 
436 aa  70.5  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  34.96 
 
 
653 aa  68.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  38.89 
 
 
824 aa  68.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  34.59 
 
 
1139 aa  67.4  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  37.4 
 
 
648 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  31.54 
 
 
503 aa  64.7  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  30.39 
 
 
491 aa  63.9  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  36 
 
 
756 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  30.66 
 
 
1259 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  31.85 
 
 
474 aa  62.4  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01820  conserved hypothetical protein  30 
 
 
571 aa  60.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  28.47 
 
 
569 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  35.87 
 
 
497 aa  60.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2054  Ricin B lectin  35.19 
 
 
459 aa  60.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  34.09 
 
 
806 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  27.22 
 
 
644 aa  59.3  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  34.09 
 
 
806 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  34.09 
 
 
806 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  34.09 
 
 
806 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  34.09 
 
 
806 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  34.09 
 
 
806 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  34.09 
 
 
806 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  30.77 
 
 
487 aa  58.9  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3632  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  41.03 
 
 
468 aa  58.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705031  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  22.36 
 
 
630 aa  58.2  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  30.77 
 
 
401 aa  58.2  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1212  hypothetical protein  32.8 
 
 
178 aa  57  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  0.337815 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1328  EnvE  33.06 
 
 
173 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1940  EnvE  33.06 
 
 
173 aa  57.4  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.155872  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6476  Ricin B lectin  30.3 
 
 
166 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  30.83 
 
 
1577 aa  57.4  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>