53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1328 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1328  EnvE  100 
 
 
173 aa  356  8e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1940  EnvE  99.42 
 
 
173 aa  355  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.155872  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2123  envelope protein EnvE  97.69 
 
 
173 aa  348  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.728766  hitchhiker  0.000157137 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1346  envelope protein EnvE  97.69 
 
 
173 aa  348  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482474  normal  0.0581998 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1361  envelope protein EnvE  97.69 
 
 
173 aa  348  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0362665  normal  0.565411 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  34.43 
 
 
368 aa  67.4  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  32.2 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  32.5 
 
 
423 aa  63.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  30.08 
 
 
558 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  32.52 
 
 
547 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  30 
 
 
500 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  34.95 
 
 
535 aa  58.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  34.57 
 
 
469 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  33.64 
 
 
603 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  31.45 
 
 
374 aa  54.7  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  37.31 
 
 
548 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  28.95 
 
 
373 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  41.79 
 
 
801 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  35.04 
 
 
1207 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.65 
 
 
476 aa  53.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  40.54 
 
 
574 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  27.35 
 
 
492 aa  50.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  38.36 
 
 
490 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  38.36 
 
 
472 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  23.96 
 
 
801 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  42.19 
 
 
461 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  31.68 
 
 
391 aa  48.9  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  36.99 
 
 
801 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  38.36 
 
 
451 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  36.49 
 
 
498 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  40.62 
 
 
489 aa  47.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  36.99 
 
 
493 aa  47.8  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  28.12 
 
 
653 aa  47.8  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  29.11 
 
 
489 aa  47.8  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  38.89 
 
 
497 aa  47.8  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  32.26 
 
 
452 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  29.7 
 
 
709 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  29.09 
 
 
568 aa  46.6  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.04 
 
 
933 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  34.72 
 
 
567 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  32.05 
 
 
516 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  35.62 
 
 
380 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  41.51 
 
 
358 aa  45.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  30.33 
 
 
384 aa  44.3  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.82 
 
 
1072 aa  44.3  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  33.78 
 
 
634 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  32.88 
 
 
446 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  25.27 
 
 
627 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  28.04 
 
 
468 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  26.67 
 
 
479 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  30.38 
 
 
589 aa  41.2  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  29.29 
 
 
417 aa  40.8  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  32.88 
 
 
890 aa  40.8  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>