More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1451 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2715  TonB-dependent receptor  70.36 
 
 		 733 aa  1028    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  66.76 
 
 		 713 aa  1021    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  66.99 
 
 		 736 aa  1031    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1802  TonB-dependent receptor  67.8 
 
 		 743 aa  1047    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  64.71 
 
 		 729 aa  1004    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2321  TonB-dependent receptor  60.59 
 
 		 744 aa  925    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.130994  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  67.22 
 
 		 712 aa  1019    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  68.74 
 
 		 744 aa  1047    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000583553  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  68.57 
 
 		 732 aa  1062    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2484  TonB-dependent receptor  70.56 
 
 		 744 aa  1031    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000223864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  63.62 
 
 		 748 aa  979    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  67.03 
 
 		 733 aa  1041    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1660  TonB-dependent receptor  69.99 
 
 		 729 aa  1022    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000750921  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  68.6 
 
 		 743 aa  1050    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 730 aa  1496    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  63.62 
 
 		 757 aa  981    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0067  TonB-dependent receptor  39.62 
 
 		 726 aa  512  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  39.89 
 
 		 697 aa  494  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1344  TonB-dependent receptor  33.75 
 
 		 687 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341297  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3405  outer membrane protein  33.47 
 
 		 714 aa  379  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.411389  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02805  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 		 696 aa  333  6e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00354555  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 720 aa  213  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 853 aa  209  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 851 aa  208  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  26.86 
 
 		 715 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 783 aa  187  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 690 aa  183  8.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 729 aa  182  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  24.24 
 
 		 695 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 690 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 687 aa  178  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 728 aa  174  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 755 aa  173  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 732 aa  171  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 747 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 713 aa  164  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 734 aa  161  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 710 aa  160  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 695 aa  159  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 720 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 764 aa  159  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 761 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 724 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  24.81 
 
 		 767 aa  158  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 704 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 718 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 773 aa  156  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 732 aa  156  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 762 aa  155  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1458  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 694 aa  154  8e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.552636  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  25.97 
 
 		 759 aa  153  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 803 aa  152  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 771 aa  152  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 763 aa  150  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 758 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 702 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 794 aa  147  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 761 aa  147  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 769 aa  147  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 773 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2110  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 765 aa  147  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0914186  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 763 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  25 
 
 		 751 aa  144  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 713 aa  144  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 733 aa  144  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 759 aa  144  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 784 aa  144  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 751 aa  143  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55050  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 684 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.04288e-20 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 765 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 766 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  25.07 
 
 		 754 aa  142  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 741 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 848 aa  141  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  25.21 
 
 		 739 aa  140  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 730 aa  140  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.14 
 
 		 755 aa  140  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 749 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 761 aa  139  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 758 aa  138  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 737 aa  137  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 710 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7293  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 835 aa  136  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.607537  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 712 aa  136  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 722 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 761 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 730 aa  135  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 763 aa  134  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 670 aa  134  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 726 aa  134  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 777 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1801  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 694 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0471088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2337  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 741 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 738 aa  133  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 771 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 728 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 666 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 767 aa  132  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 763 aa  131  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 743 aa  131  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>