180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4884 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  100 
 
 
492 aa  994    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  62.58 
 
 
507 aa  530  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02632  arabinoxylan arabinofuranohydrolase (Eurofung)  72.67 
 
 
308 aa  473  1e-132  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782111  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  54.31 
 
 
520 aa  474  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  51.65 
 
 
474 aa  462  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  72.52 
 
 
488 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07908  arabinoxylan arabinofuranohydrolase (Eurofung)  68.87 
 
 
325 aa  434  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.901711  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  67.77 
 
 
829 aa  431  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  41.01 
 
 
485 aa  224  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  36.21 
 
 
1195 aa  199  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.59 
 
 
1221 aa  198  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  71.77 
 
 
489 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  67.74 
 
 
374 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  58.99 
 
 
469 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  65.6 
 
 
500 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  64 
 
 
498 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  64.29 
 
 
380 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  62.7 
 
 
461 aa  160  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  62.2 
 
 
490 aa  160  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  62.99 
 
 
493 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  61.21 
 
 
801 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  61.11 
 
 
472 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  61.42 
 
 
801 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  62.4 
 
 
547 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  60.66 
 
 
468 aa  153  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  60.8 
 
 
535 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  60.48 
 
 
489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  56.1 
 
 
497 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  53.42 
 
 
451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  56.1 
 
 
558 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  56.69 
 
 
603 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  49.67 
 
 
548 aa  139  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  52 
 
 
368 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  34.15 
 
 
780 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  52.54 
 
 
589 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  34.15 
 
 
536 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  48.89 
 
 
479 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  51.61 
 
 
568 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  45.32 
 
 
803 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  54.76 
 
 
801 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  44.44 
 
 
516 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  44.08 
 
 
391 aa  113  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  44.83 
 
 
634 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  41.61 
 
 
709 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  45.74 
 
 
373 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  39.84 
 
 
426 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  38.99 
 
 
890 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  42.37 
 
 
492 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.83 
 
 
1072 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  41.36 
 
 
384 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  41.29 
 
 
567 aa  103  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.24 
 
 
933 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  43.61 
 
 
414 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  40.49 
 
 
417 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  45.08 
 
 
446 aa  98.2  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  42.52 
 
 
642 aa  97.8  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  42.96 
 
 
574 aa  97.1  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  44.54 
 
 
627 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  44.07 
 
 
423 aa  93.2  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  41.06 
 
 
732 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  38.26 
 
 
496 aa  89  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  41.53 
 
 
465 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.07 
 
 
531 aa  87.8  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  41.13 
 
 
1128 aa  87.4  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  42.24 
 
 
452 aa  87.4  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  35.71 
 
 
474 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  38 
 
 
1016 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  41.67 
 
 
494 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  39.55 
 
 
597 aa  83.6  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  37.14 
 
 
494 aa  83.6  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.08 
 
 
580 aa  82.4  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  36.09 
 
 
476 aa  82  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  34.32 
 
 
165 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  32.34 
 
 
1207 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  34.19 
 
 
488 aa  81.3  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  33.33 
 
 
487 aa  80.9  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  33.33 
 
 
522 aa  79.7  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  37.1 
 
 
436 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  41.13 
 
 
824 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.16 
 
 
756 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  35.66 
 
 
358 aa  77  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  39.32 
 
 
275 aa  75.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  36.84 
 
 
794 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  38.58 
 
 
1139 aa  74.7  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  32.69 
 
 
503 aa  73.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01820  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
571 aa  72.8  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  35.2 
 
 
491 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  39.52 
 
 
495 aa  71.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  32.74 
 
 
482 aa  70.1  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  32 
 
 
497 aa  70.1  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  33.33 
 
 
493 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  36.29 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  41.8 
 
 
648 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  33.78 
 
 
569 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.71 
 
 
815 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  32.84 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  31.82 
 
 
806 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  31.82 
 
 
806 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  31.82 
 
 
806 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  31.82 
 
 
806 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>