More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4606 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  48.89 
 
 		 943 aa  755    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  90.18 
 
 		 963 aa  1590    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  53.63 
 
 		 980 aa  808    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  100 
 
 		 941 aa  1845    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 1141 aa  456  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  39.77 
 
 		 957 aa  348  3e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  37.54 
 
 		 1042 aa  313  7.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  36.5 
 
 		 1058 aa  307  7e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  38.06 
 
 		 952 aa  306  9.000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  52.49 
 
 		 878 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  37.21 
 
 		 1066 aa  302  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  38.14 
 
 		 1017 aa  290  8e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  36.21 
 
 		 1050 aa  290  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  36.08 
 
 		 1100 aa  285  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  33.76 
 
 		 960 aa  283  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  38.11 
 
 		 1058 aa  278  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  36.61 
 
 		 1092 aa  278  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  38.23 
 
 		 1110 aa  278  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  39.29 
 
 		 1018 aa  277  5e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  34.34 
 
 		 1056 aa  277  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  35.5 
 
 		 1043 aa  276  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  35.69 
 
 		 969 aa  274  5.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  34.51 
 
 		 1125 aa  265  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  36.5 
 
 		 1087 aa  263  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  36.82 
 
 		 1093 aa  261  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  34.71 
 
 		 1097 aa  259  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  34.1 
 
 		 1049 aa  259  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  33.33 
 
 		 1036 aa  258  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  34.98 
 
 		 1102 aa  258  5e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  35.1 
 
 		 943 aa  252  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  37.39 
 
 		 1072 aa  251  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  35.49 
 
 		 1158 aa  247  8e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  37.08 
 
 		 922 aa  244  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 1082 aa  242  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  35.91 
 
 		 1055 aa  239  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  34.16 
 
 		 1103 aa  237  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  36.04 
 
 		 1094 aa  226  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  33.88 
 
 		 1064 aa  224  8e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  39.76 
 
 		 1028 aa  222  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  36.35 
 
 		 1060 aa  222  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  33.14 
 
 		 1131 aa  218  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  34.42 
 
 		 1048 aa  213  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 882 aa  211  5e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  34.57 
 
 		 1049 aa  207  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  36.81 
 
 		 840 aa  205  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  33.62 
 
 		 1005 aa  203  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  28.3 
 
 		 792 aa  202  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  41.98 
 
 		 824 aa  201  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  29.18 
 
 		 999 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  36.62 
 
 		 760 aa  198  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 755 aa  196  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  41.76 
 
 		 919 aa  196  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 887 aa  195  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  36.87 
 
 		 1085 aa  193  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 1085 aa  192  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  38.67 
 
 		 1186 aa  192  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  36.12 
 
 		 921 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  39.43 
 
 		 781 aa  190  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  37.72 
 
 		 972 aa  189  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  34.27 
 
 		 1076 aa  189  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  35.92 
 
 		 931 aa  187  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  38.66 
 
 		 818 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  38.58 
 
 		 916 aa  185  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 775 aa  185  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  32.38 
 
 		 701 aa  184  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  37.28 
 
 		 765 aa  184  9.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2197  transcriptional regulator  33.23 
 
 		 630 aa  182  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.774056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3308  transcriptional regulator, winged helix family  35.19 
 
 		 1005 aa  183  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000076041  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  39.71 
 
 		 973 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 1137 aa  182  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  39.43 
 
 		 973 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  37.28 
 
 		 877 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  31.86 
 
 		 1100 aa  180  9e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  39.59 
 
 		 886 aa  179  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  37.78 
 
 		 1227 aa  177  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  33.48 
 
 		 780 aa  177  8e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  40.91 
 
 		 948 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 393 aa  175  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  34.33 
 
 		 959 aa  174  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  41.16 
 
 		 951 aa  174  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  37.07 
 
 		 966 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 1064 aa  173  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  40.91 
 
 		 948 aa  172  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  31.99 
 
 		 1161 aa  171  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  32.68 
 
 		 816 aa  171  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  37.11 
 
 		 1010 aa  171  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6569  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 1027 aa  171  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  34.62 
 
 		 827 aa  170  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5104  transcriptional regulator, SARP family  33.91 
 
 		 994 aa  170  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  36.39 
 
 		 973 aa  169  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  35.96 
 
 		 768 aa  169  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  33.41 
 
 		 961 aa  168  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2058  transcriptional activator domain-containing protein  32.7 
 
 		 630 aa  167  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.366352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0444  transcriptional regulator, LuxR family  36.55 
 
 		 938 aa  167  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.192623  normal  0.240024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  29.54 
 
 		 776 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  35.58 
 
 		 950 aa  167  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  39.9 
 
 		 591 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  33.5 
 
 		 922 aa  166  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  36.57 
 
 		 658 aa  165  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2391  transcriptional regulator  38.12 
 
 		 954 aa  165  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.814373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>