More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3025 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3258  TonB-dependent receptor plug  36.4 
 
 		 1099 aa  653    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363911  normal  0.0250929 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2062  TonB-dependent receptor plug  45.95 
 
 		 1110 aa  957    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000641911  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3025  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1128 aa  2298    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.982637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3579  TonB-dependent receptor  35.07 
 
 		 1059 aa  589  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157085  normal  0.780186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  34.46 
 
 		 1070 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  35.41 
 
 		 1143 aa  569  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2627  TonB-dependent receptor plug  33.07 
 
 		 1117 aa  530  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.454001  normal  0.67516 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1023 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  27.09 
 
 		 1129 aa  340  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  27.51 
 
 		 1060 aa  339  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  28.46 
 
 		 1177 aa  335  3e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  28.66 
 
 		 1085 aa  334  7.000000000000001e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 1051 aa  332  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  28.75 
 
 		 1064 aa  332  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1574  TonB-dependent receptor plug  27.19 
 
 		 1155 aa  328  5e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923861  normal  0.0467053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  27.87 
 
 		 1034 aa  325  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  27.28 
 
 		 1181 aa  325  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 		 1155 aa  325  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 1047 aa  322  3e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  26.83 
 
 		 1082 aa  322  3.9999999999999996e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  27.52 
 
 		 1017 aa  319  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 1025 aa  319  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  26.61 
 
 		 1037 aa  316  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 1014 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 1023 aa  314  6.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 1071 aa  313  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1601  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 1055 aa  311  6.999999999999999e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.709185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  27.88 
 
 		 1160 aa  306  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  28.27 
 
 		 1137 aa  304  7.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 		 1034 aa  302  2e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  27.3 
 
 		 1066 aa  300  8e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 1013 aa  299  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  28.18 
 
 		 1105 aa  296  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 		 1052 aa  296  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  26.26 
 
 		 1019 aa  292  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 1043 aa  291  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  26.4 
 
 		 1006 aa  291  5.0000000000000004e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5674  TonB-dependent receptor plug  26.74 
 
 		 1038 aa  291  6e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 1008 aa  291  7e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  27.09 
 
 		 1076 aa  288  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 1029 aa  288  5e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  27.42 
 
 		 1155 aa  287  8e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  27.14 
 
 		 1095 aa  287  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 		 1043 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  26.49 
 
 		 1172 aa  286  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 1138 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 1127 aa  285  4.0000000000000003e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2820  TonB-dependent receptor plug  26.96 
 
 		 1057 aa  282  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  26.08 
 
 		 1188 aa  281  4e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 1144 aa  281  5e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 1037 aa  281  7e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  26.31 
 
 		 1154 aa  280  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  26.71 
 
 		 1119 aa  278  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 1164 aa  278  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 1083 aa  277  8e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  26.28 
 
 		 1047 aa  276  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 		 1202 aa  276  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  26.43 
 
 		 1096 aa  275  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  26.71 
 
 		 1079 aa  273  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  28.01 
 
 		 1006 aa  273  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  30.62 
 
 		 1076 aa  272  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  26.02 
 
 		 1066 aa  272  2.9999999999999997e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  27.05 
 
 		 1079 aa  271  5e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4184  TonB-dependent receptor plug  25.59 
 
 		 1042 aa  271  5.9999999999999995e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  26.41 
 
 		 1062 aa  270  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  26.43 
 
 		 1036 aa  268  5.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1259  TonB-dependent receptor plug  25.47 
 
 		 1106 aa  266  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 1175 aa  267  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  27.09 
 
 		 1190 aa  265  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 996 aa  265  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 		 1020 aa  263  1e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  25.5 
 
 		 1217 aa  260  9e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2226  TonB-dependent receptor plug  33.01 
 
 		 1117 aa  259  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.377553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 		 1038 aa  259  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 		 1053 aa  258  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  25.73 
 
 		 1023 aa  258  5e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 		 1064 aa  258  6e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  26.55 
 
 		 1076 aa  257  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  24.98 
 
 		 1100 aa  255  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  25.98 
 
 		 1008 aa  254  9.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  25.86 
 
 		 1041 aa  253  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0185  ragA protein  26.44 
 
 		 1017 aa  253  2e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.458513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  25.13 
 
 		 1095 aa  253  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 1086 aa  252  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2109  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 1154 aa  251  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  25.2 
 
 		 1111 aa  250  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  25.94 
 
 		 1104 aa  249  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  25.7 
 
 		 1095 aa  248  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0269  TonB-dependent receptor plug  26.02 
 
 		 1018 aa  248  4e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2990  TonB-dependent receptor plug  25.44 
 
 		 1077 aa  247  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.366302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  27.5 
 
 		 1019 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  25.87 
 
 		 1045 aa  243  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  26.31 
 
 		 1128 aa  239  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  26.5 
 
 		 1047 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4491  TonB-dependent receptor, plug  26.55 
 
 		 1129 aa  235  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2810  TonB-dependent receptor plug  26.28 
 
 		 1048 aa  231  8e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  28.76 
 
 		 992 aa  229  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 1033 aa  227  8e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  24.77 
 
 		 1198 aa  225  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6166  TonB-dependent receptor plug  26.1 
 
 		 977 aa  224  8e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679734  decreased coverage  0.00200292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>