170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4873 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  74.12 
 
 
498 aa  655    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  100 
 
 
489 aa  979    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  58.93 
 
 
500 aa  530  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  57.17 
 
 
493 aa  525  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5160  Xylan 1,4-beta-xylosidase  74.05 
 
 
519 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0027116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  76.04 
 
 
479 aa  460  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01571  Alpha-L-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74288]  65.87 
 
 
510 aa  422  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.611829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  51.22 
 
 
627 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2258  xylan 1,4-beta-xylosidase  51.12 
 
 
1102 aa  324  2e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219101  normal  0.0256212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  54.4 
 
 
499 aa  319  6e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7478  Xylan 1,4-beta-xylosidase  46.95 
 
 
635 aa  314  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414529  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4972  Xylan 1,4-beta-xylosidase  43.88 
 
 
632 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122581  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  68 
 
 
801 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  75.76 
 
 
461 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  74.02 
 
 
472 aa  200  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  74.22 
 
 
490 aa  199  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  64.97 
 
 
451 aa  194  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  73.44 
 
 
380 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  74.02 
 
 
468 aa  186  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  69.05 
 
 
547 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  56.52 
 
 
469 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  63.25 
 
 
374 aa  158  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  59.42 
 
 
492 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  61.54 
 
 
801 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  62.9 
 
 
535 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  57.14 
 
 
558 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  57.02 
 
 
603 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  56.8 
 
 
489 aa  140  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  41.57 
 
 
368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  51.67 
 
 
589 aa  123  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  42.48 
 
 
548 aa  120  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  45 
 
 
497 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  38.82 
 
 
803 aa  107  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  45.45 
 
 
479 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  45.24 
 
 
568 aa  96.7  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  40.34 
 
 
634 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  40.16 
 
 
567 aa  94.4  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  40.5 
 
 
492 aa  94  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  37.29 
 
 
426 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  38.64 
 
 
391 aa  91.3  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  37.86 
 
 
516 aa  91.3  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  44.44 
 
 
373 aa  90.9  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  45.65 
 
 
824 aa  90.5  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  36.3 
 
 
890 aa  89.7  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  41.73 
 
 
574 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.32 
 
 
933 aa  88.6  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 
709 aa  87.8  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  41.8 
 
 
642 aa  87.8  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  41.53 
 
 
452 aa  87  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  38.64 
 
 
165 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  42.37 
 
 
384 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  41.27 
 
 
1016 aa  84.3  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  39.37 
 
 
446 aa  84  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  40.65 
 
 
494 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  38.14 
 
 
414 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.29 
 
 
1072 aa  80.5  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  32.91 
 
 
493 aa  80.1  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  41.03 
 
 
732 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  40.17 
 
 
417 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  36.89 
 
 
436 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  37.59 
 
 
494 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.2 
 
 
756 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  33.56 
 
 
488 aa  73.9  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.16 
 
 
476 aa  72.8  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2713  hypothetical protein  45.35 
 
 
679 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.442096 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  31.01 
 
 
597 aa  73.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  34.45 
 
 
1207 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  35.48 
 
 
465 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  50.7 
 
 
801 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  33.14 
 
 
482 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  32.89 
 
 
522 aa  70.5  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  36.72 
 
 
1128 aa  70.5  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  35.9 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  36.84 
 
 
503 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  34.45 
 
 
423 aa  69.3  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.5 
 
 
531 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01820  conserved hypothetical protein  31.11 
 
 
571 aa  67.4  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  34.4 
 
 
491 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  32.8 
 
 
672 aa  66.6  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  37.12 
 
 
1139 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  36.36 
 
 
653 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  33.33 
 
 
496 aa  65.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  32.06 
 
 
497 aa  65.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2054  Ricin B lectin  37.9 
 
 
459 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3154  Ricin B lectin  30.41 
 
 
382 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  37.31 
 
 
806 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  37.31 
 
 
806 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  42.17 
 
 
569 aa  64.3  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  37.31 
 
 
806 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  37.31 
 
 
806 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  37.5 
 
 
794 aa  63.9  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  29.69 
 
 
358 aa  63.9  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  35.77 
 
 
487 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  48.86 
 
 
648 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  36.57 
 
 
806 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  36.57 
 
 
806 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  36.57 
 
 
806 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4149  Ricin B lectin  32.83 
 
 
320 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.255794  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.48 
 
 
580 aa  61.6  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.88 
 
 
815 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>