More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4276 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 798 aa  1625    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  62.56 
 
 		 788 aa  981    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1050  TonB-dependent receptor, plug  42.55 
 
 		 830 aa  624  1e-177  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.908027 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  36.01 
 
 		 808 aa  469  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 753 aa  241  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 763 aa  233  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  28.43 
 
 		 785 aa  227  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 802 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  26 
 
 		 771 aa  214  5.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 757 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  27.61 
 
 		 822 aa  196  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 734 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 780 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 742 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 802 aa  194  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 791 aa  194  7e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 747 aa  193  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 795 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 780 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 766 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 734 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 777 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 797 aa  191  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 847 aa  191  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 781 aa  190  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  25 
 
 		 889 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  26.18 
 
 		 856 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 807 aa  184  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 762 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 795 aa  182  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 786 aa  182  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 795 aa  182  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 792 aa  181  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 712 aa  179  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 777 aa  177  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 806 aa  172  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  26.56 
 
 		 784 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 808 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 703 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 783 aa  167  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 752 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 723 aa  167  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 766 aa  167  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 729 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 753 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 704 aa  162  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 761 aa  161  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 755 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 875 aa  159  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 783 aa  157  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 904 aa  154  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  25.27 
 
 		 767 aa  153  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  25.07 
 
 		 715 aa  152  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 720 aa  152  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 749 aa  151  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 780 aa  150  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 783 aa  147  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 758 aa  147  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 778 aa  147  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 763 aa  147  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  24.21 
 
 		 846 aa  146  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 747 aa  146  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  25.25 
 
 		 741 aa  144  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 790 aa  144  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 800 aa  144  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 800 aa  144  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1059  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 777 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000502668  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 731 aa  143  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 803 aa  142  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  22.15 
 
 		 732 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 736 aa  141  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 702 aa  141  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  24.33 
 
 		 755 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 774 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 722 aa  140  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 853 aa  140  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 713 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 724 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  25.3 
 
 		 739 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 784 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 774 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 794 aa  139  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 790 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 769 aa  138  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 763 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 778 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 695 aa  138  4e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 744 aa  138  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 763 aa  138  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 761 aa  138  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 690 aa  137  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 790 aa  137  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 687 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 765 aa  136  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 769 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 759 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 851 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 746 aa  135  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 796 aa  135  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_010338  Caul_2726  TonB-dependent receptor plug  25.07 
 
 		 829 aa  135  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.298925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>