More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4126 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4126  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1134 aa  2305    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.504086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4139  TonB-dependent receptor plug  49.7 
 
 		 1139 aa  1045    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.380719 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  36.12 
 
 		 1095 aa  568  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  32.19 
 
 		 1217 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  32.87 
 
 		 1188 aa  452  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  30.5 
 
 		 1190 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6660  TonB-dependent receptor plug  31.77 
 
 		 1075 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150052  normal  0.983819 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  31.12 
 
 		 1064 aa  395  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3773  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 		 1120 aa  392  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.466105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  29.97 
 
 		 1146 aa  386  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 1168 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1139 aa  362  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  29.43 
 
 		 1138 aa  340  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 1177 aa  337  7e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 		 1034 aa  333  1e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  29.47 
 
 		 1095 aa  329  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 1028 aa  326  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  27.05 
 
 		 1036 aa  319  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 1144 aa  318  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 1050 aa  316  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 1049 aa  317  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 		 1008 aa  315  3.9999999999999997e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  27.13 
 
 		 1082 aa  314  4.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  25.34 
 
 		 1038 aa  314  6.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  28.3 
 
 		 1076 aa  310  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 1063 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  27.93 
 
 		 1155 aa  304  7.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  27.32 
 
 		 1080 aa  304  8.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  28.18 
 
 		 1051 aa  303  9e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  27.67 
 
 		 1006 aa  303  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  27.62 
 
 		 1053 aa  303  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  27.91 
 
 		 1023 aa  302  3e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 1033 aa  301  6e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 1036 aa  300  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  26.6 
 
 		 1152 aa  299  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 1013 aa  299  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  27.45 
 
 		 1036 aa  299  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 1095 aa  298  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  29.46 
 
 		 986 aa  298  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5486  TonB-dependent receptor plug  27.25 
 
 		 1147 aa  296  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.067232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 1038 aa  295  4e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 1128 aa  294  5e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  26.79 
 
 		 1132 aa  295  5e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 1027 aa  290  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  28.35 
 
 		 1013 aa  290  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 1011 aa  289  2.9999999999999996e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 1008 aa  288  4e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 1037 aa  285  4.0000000000000003e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  27.83 
 
 		 1030 aa  283  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  25.54 
 
 		 1021 aa  283  2e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2990  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 		 1077 aa  281  4e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.366302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 1080 aa  281  6e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  28.97 
 
 		 1142 aa  281  7e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  27.1 
 
 		 1003 aa  280  1e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  27.82 
 
 		 1047 aa  280  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  26.64 
 
 		 1177 aa  280  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  27.08 
 
 		 1109 aa  279  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  26.83 
 
 		 1040 aa  275  5.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 1192 aa  274  6e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  25.75 
 
 		 1023 aa  271  8e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  27.56 
 
 		 1034 aa  269  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  31.93 
 
 		 1100 aa  266  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  27.67 
 
 		 1179 aa  267  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 1076 aa  266  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  26.45 
 
 		 1154 aa  265  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  27.17 
 
 		 1018 aa  264  6.999999999999999e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  27.42 
 
 		 1119 aa  264  8e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  25.99 
 
 		 1122 aa  261  5.0000000000000005e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  25.45 
 
 		 1103 aa  261  5.0000000000000005e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  26.66 
 
 		 1060 aa  261  6e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  25.5 
 
 		 1070 aa  261  6e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  26 
 
 		 1074 aa  261  6e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 1065 aa  261  7e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 994 aa  259  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 1024 aa  257  9e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 		 1102 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  25.75 
 
 		 1023 aa  256  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 		 979 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  26.42 
 
 		 1130 aa  255  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  25.53 
 
 		 1128 aa  255  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  26.66 
 
 		 1029 aa  252  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  25.41 
 
 		 1031 aa  248  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 1086 aa  244  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5835  TonB-dependent receptor plug  25.77 
 
 		 1033 aa  244  7.999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880431  normal  0.557328 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  24.65 
 
 		 1014 aa  244  9e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 1148 aa  243  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4329  TonB-dependent receptor, plug  25.58 
 
 		 1005 aa  243  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  24.71 
 
 		 986 aa  241  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 1031 aa  240  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  29.68 
 
 		 1104 aa  239  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 1027 aa  239  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5705  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 1011 aa  234  9e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.091818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  25.4 
 
 		 1119 aa  234  9e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 1041 aa  231  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  30.02 
 
 		 1045 aa  229  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2221  TonB-dependent receptor plug  25.8 
 
 		 1079 aa  226  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 1056 aa  226  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  25.99 
 
 		 1036 aa  226  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 		 1160 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  25.97 
 
 		 1146 aa  224  9e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>