More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0710 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  59.01 
 
 		 1062 aa  1226    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2299  TonB-dependent receptor plug  56.14 
 
 		 1056 aa  1165    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531432  normal  0.0856053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6796  TonB-dependent receptor  47.89 
 
 		 1081 aa  974    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000906345  hitchhiker  0.0000117399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1176 aa  2404    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2857  TonB-dependent receptor plug  47.23 
 
 		 1148 aa  1006    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.22615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4101  TonB-dependent receptor plug  55.62 
 
 		 1068 aa  1133    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0501  TonB-dependent receptor plug  49.18 
 
 		 1086 aa  968    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00157557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  33.53 
 
 		 1130 aa  627  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  33.31 
 
 		 1123 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5835  TonB-dependent receptor plug  35.37 
 
 		 1033 aa  572  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880431  normal  0.557328 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  35.85 
 
 		 1006 aa  536  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1109 aa  508  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 1145 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  31.42 
 
 		 1027 aa  469  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 		 1056 aa  452  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  31.11 
 
 		 1127 aa  453  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  30.9 
 
 		 1029 aa  451  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0566  TonB-dependent receptor plug  30.46 
 
 		 1043 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00250412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 1018 aa  429  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  30.31 
 
 		 1036 aa  423  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 		 1131 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 1045 aa  412  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  29.71 
 
 		 1094 aa  405  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  29.01 
 
 		 1124 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 1144 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 1140 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 1061 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 1056 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 1146 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  30.05 
 
 		 1079 aa  386  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  28.51 
 
 		 1047 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  29.98 
 
 		 1046 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 1086 aa  380  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 1128 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  30.46 
 
 		 1026 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1124  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 953 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223448  hitchhiker  0.00360467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 1093 aa  370  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 		 1095 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  30.36 
 
 		 1020 aa  367  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3875  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 937 aa  365  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 1155 aa  363  8e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  27.35 
 
 		 1192 aa  360  7e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  28.26 
 
 		 1148 aa  358  3.9999999999999996e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  26.3 
 
 		 1132 aa  352  3e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  27.25 
 
 		 1181 aa  347  5e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  26.96 
 
 		 1188 aa  347  8e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  27.11 
 
 		 1217 aa  345  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 1060 aa  344  5e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  26.96 
 
 		 1128 aa  344  5.999999999999999e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2243  TonB-dependent receptor  29.71 
 
 		 913 aa  344  7e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 1095 aa  342  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  29.05 
 
 		 1019 aa  342  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 1164 aa  341  5e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1036 aa  340  8e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  27.21 
 
 		 1138 aa  340  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  27.28 
 
 		 1139 aa  336  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  26.53 
 
 		 1190 aa  334  7.000000000000001e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  26.95 
 
 		 1097 aa  333  9e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  28.6 
 
 		 1024 aa  332  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 1130 aa  332  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4814  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 1025 aa  332  3e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0976743  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 1013 aa  332  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  27.65 
 
 		 1116 aa  332  4e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  26.27 
 
 		 1114 aa  329  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 		 1168 aa  328  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 1031 aa  327  9e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  26.37 
 
 		 1129 aa  320  9e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  26.59 
 
 		 1104 aa  318  4e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  27.99 
 
 		 1038 aa  318  5e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  25.33 
 
 		 1148 aa  316  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2101  TonB-dependent receptor plug  27.47 
 
 		 1038 aa  315  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.693236  normal  0.298537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  26.6 
 
 		 1128 aa  314  6.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  27.64 
 
 		 1036 aa  311  4e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  28.07 
 
 		 1052 aa  311  4e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  27.4 
 
 		 1045 aa  310  8e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 1189 aa  308  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 1006 aa  308  5.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 		 1028 aa  304  6.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  26.81 
 
 		 1079 aa  303  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 1075 aa  301  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  28.38 
 
 		 1051 aa  301  5e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  26.62 
 
 		 989 aa  301  6e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  26.57 
 
 		 1004 aa  297  8e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  25.29 
 
 		 1202 aa  297  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  26.4 
 
 		 1116 aa  296  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  26.93 
 
 		 1102 aa  295  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 1010 aa  295  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  26.45 
 
 		 1172 aa  295  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 1000 aa  294  6e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 1034 aa  294  7e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 1128 aa  294  9e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  26.62 
 
 		 1154 aa  291  5.0000000000000004e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1298  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 929 aa  290  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0684189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  27.28 
 
 		 1039 aa  290  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 		 1010 aa  290  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  25.3 
 
 		 1117 aa  288  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 1065 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  27.01 
 
 		 1066 aa  288  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 1008 aa  284  8.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 1011 aa  282  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>